285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1559 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  46.37 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  52.1 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.84 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  45.85 
 
 		 295 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.49 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  47.06 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  47.06 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  47.06 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.89 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  45.23 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  42.01 
 
 		 288 aa  209  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  42.65 
 
 		 279 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  38.14 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  42.55 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  39.57 
 
 		 297 aa  169  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  39.01 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  41.03 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  42.2 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  41.43 
 
 		 288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  41.34 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  37.93 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  35.31 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  38.49 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  38.49 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  32.62 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  35.27 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  36.61 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  36.36 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  32.75 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  35.42 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  37.22 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  30.69 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  35.92 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.02 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.5 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  31.89 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  33.9 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  35.54 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.97 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.1 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  30.77 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.11 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.11 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  32.96 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  32.43 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  32.83 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  33.74 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  33.62 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.88 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  29.15 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  32.08 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  31.6 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  32.23 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.31 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.95 
 
 		 301 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  31.69 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.14 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  35.15 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  30.69 
 
 		 294 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  29.21 
 
 		 297 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  30.58 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.25 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  28.14 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  28.81 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  28.81 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  32.39 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  28.19 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  33.33 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  36.23 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.82 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  31.55 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  32.53 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  32.04 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.85 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  30.42 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  30.42 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  33.49 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  32.24 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  31.69 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  29.35 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  27.24 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  28.67 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  30.45 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.82 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  32.33 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  29.82 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  33.95 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  30.07 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>