179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1554 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
202 aa  408  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  45.35 
 
 
185 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  43.79 
 
 
221 aa  128  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  46.97 
 
 
189 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  46.97 
 
 
189 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  39.31 
 
 
195 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  37.12 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  44.78 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  44.85 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  42.38 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  44.87 
 
 
185 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  45.74 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  44.96 
 
 
214 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  44.44 
 
 
242 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  43.38 
 
 
242 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  42.5 
 
 
163 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  38.16 
 
 
161 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  41.91 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  40.16 
 
 
171 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  43.7 
 
 
176 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  42 
 
 
227 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  42.67 
 
 
227 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  41.18 
 
 
172 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  43.28 
 
 
243 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  41.33 
 
 
171 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  43.51 
 
 
227 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  45 
 
 
192 aa  98.6  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  40.13 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  39.35 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  38.97 
 
 
358 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  38.89 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  37.33 
 
 
167 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  34.64 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  34.64 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  38.06 
 
 
534 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  37.93 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  40.14 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  35.06 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.49 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.09 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.96 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  40.29 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.42 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  28.57 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  41.01 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  36.15 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.48 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  36.97 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  34.71 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  29.17 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.68 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.11 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  34.85 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.41 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  33.33 
 
 
148 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  42.27 
 
 
158 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  34.62 
 
 
250 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  35.11 
 
 
246 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  28.57 
 
 
232 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  33.75 
 
 
157 aa  61.6  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  34.84 
 
 
263 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  32.81 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.72 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.54 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  40.62 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30.86 
 
 
155 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  32.82 
 
 
263 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32.5 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  30.99 
 
 
231 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  35.21 
 
 
175 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  28.25 
 
 
175 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  37.7 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  29.87 
 
 
244 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.03 
 
 
153 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.41 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  33.06 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.56 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  32.37 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 
169 aa  55.1  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  30.47 
 
 
153 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  31.1 
 
 
224 aa  55.1  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  30.88 
 
 
153 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  34.92 
 
 
153 aa  54.7  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  31.3 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  28.83 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  26.19 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  30.34 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  29.63 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  33.96 
 
 
114 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  33.1 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  29.46 
 
 
158 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  30.34 
 
 
166 aa  52.4  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  30.89 
 
 
194 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  27.4 
 
 
185 aa  52  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  31.88 
 
 
216 aa  52  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  29.93 
 
 
162 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>