More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1553 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 505 aa  1031    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  51.29 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.3 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.49 
 
 		 511 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  50.5 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  46.77 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 536 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 536 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  48.08 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.33 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  48.08 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  42.94 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 		 531 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 533 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 530 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 594 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 518 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.77 
 
 		 509 aa  246  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 523 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.41 
 
 		 717 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 		 798 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 		 617 aa  219  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 		 620 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 		 911 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 769 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 		 769 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 600 aa  207  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 778 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 772 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 		 769 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 		 583 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 770 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  43.12 
 
 		 790 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 643 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  46.44 
 
 		 771 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 844 aa  203  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  38.93 
 
 		 470 aa  203  7e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 605 aa  202  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 389 aa  202  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  45.53 
 
 		 783 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  46.44 
 
 		 771 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  45.53 
 
 		 783 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  45.61 
 
 		 774 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 		 775 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 784 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  44.17 
 
 		 648 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 		 646 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 836 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  37.4 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 704 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 562 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 775 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 774 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 779 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 969 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  44.59 
 
 		 599 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 773 aa  193  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 		 728 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 513 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  44.26 
 
 		 773 aa  191  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 1000 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 1192 aa  191  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3322  histidine kinase  47.64 
 
 		 278 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.770446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 468 aa  190  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 764 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  38.25 
 
 		 1035 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 		 630 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  41.7 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  43.42 
 
 		 525 aa  187  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 614 aa  187  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 782 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 494 aa  186  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 1138 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  37.85 
 
 		 1035 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 606 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 614 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  40.23 
 
 		 508 aa  183  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 605 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 1055 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 1296 aa  180  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 1276 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  37.7 
 
 		 1410 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 853 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 612 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_002978  WD1284  sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 475 aa  175  9.999999999999999e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 661 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  37.09 
 
 		 288 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 627 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 713 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 786 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  38.2 
 
 		 609 aa  174  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  38.2 
 
 		 609 aa  174  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0003  sensor histidine kinase  39.92 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0648198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>