More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1450 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  100 
 
 
426 aa  840    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  69.88 
 
 
912 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  70.15 
 
 
895 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  65.54 
 
 
905 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  64.85 
 
 
441 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  67.89 
 
 
402 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  67.47 
 
 
453 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  68.97 
 
 
413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  64.34 
 
 
443 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  66.12 
 
 
917 aa  508  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  68.5 
 
 
422 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  70.17 
 
 
424 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  66.35 
 
 
460 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  65.47 
 
 
459 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  65.38 
 
 
460 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  63.64 
 
 
452 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  59.18 
 
 
893 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  49.04 
 
 
426 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  49.04 
 
 
426 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  48 
 
 
428 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  47.9 
 
 
435 aa  378  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  52.5 
 
 
431 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  48.33 
 
 
426 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  52.5 
 
 
431 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  47.77 
 
 
435 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 
420 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  48 
 
 
417 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  49.28 
 
 
426 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  49.28 
 
 
426 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  47.67 
 
 
422 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  49.28 
 
 
426 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  47.07 
 
 
420 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  49.28 
 
 
426 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  45.5 
 
 
440 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  49.63 
 
 
409 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  48.1 
 
 
436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  44.42 
 
 
418 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 
438 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 
438 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 
417 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  48.45 
 
 
427 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  47.75 
 
 
439 aa  345  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  48.68 
 
 
429 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  48.61 
 
 
437 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  45.66 
 
 
425 aa  338  9e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  43.98 
 
 
409 aa  324  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  40.24 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  43.7 
 
 
418 aa  320  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  40.1 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  43.66 
 
 
421 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  44.79 
 
 
422 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  43.52 
 
 
421 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  44.85 
 
 
424 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  44.77 
 
 
424 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  43.91 
 
 
424 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  44.61 
 
 
424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 
444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
428 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  35.25 
 
 
431 aa  297  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  46 
 
 
472 aa  289  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  47.46 
 
 
472 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 
506 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  40.68 
 
 
411 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  30.75 
 
 
389 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  30.75 
 
 
389 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  30.5 
 
 
389 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  30.75 
 
 
389 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  30.75 
 
 
389 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  30.58 
 
 
389 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  30.75 
 
 
389 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  30.5 
 
 
389 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  30.5 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  38.89 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  31.5 
 
 
389 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  37.01 
 
 
394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 
395 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
397 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  28.89 
 
 
389 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  28.89 
 
 
389 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  34.56 
 
 
404 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
398 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  28.26 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
398 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
382 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  32.24 
 
 
403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 
403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  31.73 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  32.45 
 
 
406 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  32.45 
 
 
406 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  32.51 
 
 
406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 
406 aa  162  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  33.06 
 
 
403 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  32 
 
 
403 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  33.07 
 
 
406 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  35.73 
 
 
398 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  33.06 
 
 
403 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  30.5 
 
 
423 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  30.3 
 
 
411 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  34.05 
 
 
403 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>