More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1323 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.43 
 
 
481 aa  663    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3829  succinate semialdehyde dehydrogenase  67.86 
 
 
482 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.61 
 
 
490 aa  692    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  985    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  67.02 
 
 
492 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.28 
 
 
483 aa  632  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.87 
 
 
485 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.7 
 
 
483 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  61.9 
 
 
483 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.87 
 
 
485 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.58 
 
 
486 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.43 
 
 
489 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.66 
 
 
484 aa  621  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
489 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
489 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
489 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.5 
 
 
493 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
489 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
489 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  61.22 
 
 
489 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.46 
 
 
483 aa  614  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.67 
 
 
486 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.46 
 
 
482 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.46 
 
 
482 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.42 
 
 
480 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.21 
 
 
480 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.88 
 
 
482 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.42 
 
 
480 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.59 
 
 
509 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.88 
 
 
482 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.88 
 
 
482 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.25 
 
 
482 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.4 
 
 
484 aa  608  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  59.04 
 
 
482 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.96 
 
 
493 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.04 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  59.04 
 
 
482 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.04 
 
 
482 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.88 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60.08 
 
 
480 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.71 
 
 
492 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.34 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.04 
 
 
482 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.42 
 
 
484 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  60 
 
 
480 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.04 
 
 
484 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  59.17 
 
 
480 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.63 
 
 
500 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  59.17 
 
 
480 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0428  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.29 
 
 
486 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.5 
 
 
489 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.71 
 
 
489 aa  601  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.5 
 
 
489 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.5 
 
 
489 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.08 
 
 
489 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.08 
 
 
489 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.42 
 
 
500 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.87 
 
 
489 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.61 
 
 
479 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.71 
 
 
500 aa  591  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.17 
 
 
493 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.96 
 
 
492 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.35 
 
 
484 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.67 
 
 
486 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.98 
 
 
483 aa  589  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.25 
 
 
491 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  60.21 
 
 
486 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  60 
 
 
486 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.3 
 
 
483 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3342  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.92 
 
 
492 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.420157  normal  0.140471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.58 
 
 
486 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.98 
 
 
486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  60.04 
 
 
497 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  58.07 
 
 
480 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.52 
 
 
489 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  55.46 
 
 
491 aa  568  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.66 
 
 
482 aa  571  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.49 
 
 
485 aa  568  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.24 
 
 
482 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.71 
 
 
488 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.81 
 
 
482 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2672  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.75 
 
 
492 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.582581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
482 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1012  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.75 
 
 
511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.09 
 
 
490 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
495 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  54.17 
 
 
482 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.81 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  55 
 
 
484 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.83 
 
 
484 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.95 
 
 
492 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.91 
 
 
483 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.12 
 
 
486 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.24 
 
 
488 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.58 
 
 
482 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
486 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2886  succinic semialdehyde dehydrogenase  59.79 
 
 
486 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.88 
 
 
499 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.51 
 
 
484 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.14 
 
 
490 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>