More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1300 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  64 
 
 		 306 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  65 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 298 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  57.59 
 
 		 299 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  57.59 
 
 		 313 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2586  transcriptional regulator LysR family  53.55 
 
 		 324 aa  320  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 290 aa  272  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5053  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426603  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 322 aa  205  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 283 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  38.81 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4540  LysR substrate-binding  44.8 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5000  transcriptional regulator, LysR family  44.8 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  39.27 
 
 		 293 aa  195  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5787  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6152  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6632  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5807  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6037  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7706  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.16 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  41.09 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  40.23 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4219  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  37.31 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 291 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1608  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  40.84 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4271  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 289 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4357  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  35.8 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0095  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1492  transcriptional regulator, LysR family  37.6 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.403981  hitchhiker  0.0000917621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  34.86 
 
 		 285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  35.36 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2647  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  37.99 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1269  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0299945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  35.36 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  35.56 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0800  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2476  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.985162  normal  0.348723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 294 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0282  hypothetical protein  33.21 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0961  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0277  hypothetical protein  33.09 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0368  LysR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>