More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1053 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 478 aa  976    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  54.64 
 
 		 482 aa  521  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  52.99 
 
 		 477 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  52.46 
 
 		 493 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  52.56 
 
 		 477 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  53.21 
 
 		 477 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  53.38 
 
 		 478 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  52.35 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  52.64 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  52.35 
 
 		 477 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 		 482 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  51.16 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 		 475 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  51.48 
 
 		 478 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  51.58 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  51.39 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.27 
 
 		 481 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.27 
 
 		 481 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  52.74 
 
 		 480 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  49.05 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  48.85 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.16 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  52.01 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.21 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  51.37 
 
 		 481 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  51.16 
 
 		 481 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.28 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  51.16 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  50.21 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.84 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.11 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  51.37 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  50.53 
 
 		 477 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.37 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  49.05 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.16 
 
 		 476 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  45.24 
 
 		 477 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  46.93 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  45.05 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  46.04 
 
 		 487 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.11 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  44.42 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  43.76 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  45.92 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  43.83 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  41.16 
 
 		 486 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.33 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 489 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.56 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.11 
 
 		 485 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.77 
 
 		 485 aa  362  8e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 479 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.08 
 
 		 493 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.59 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.04 
 
 		 483 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.04 
 
 		 483 aa  358  9e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.04 
 
 		 483 aa  358  9e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.04 
 
 		 483 aa  358  9e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.61 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.83 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.61 
 
 		 483 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.09 
 
 		 483 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 484 aa  355  6.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.61 
 
 		 483 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.57 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.4 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 484 aa  353  5e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.37 
 
 		 483 aa  352  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.08 
 
 		 486 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.57 
 
 		 480 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 478 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.52 
 
 		 486 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  42.19 
 
 		 485 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.54 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.44 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 484 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 484 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.61 
 
 		 483 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.14 
 
 		 482 aa  349  7e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.44 
 
 		 480 aa  349  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0265  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.83 
 
 		 484 aa  348  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.92 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.9 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 489 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  38.92 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.34 
 
 		 489 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.92 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.01 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>