71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0939 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0939  porin  100 
 
 		 401 aa  810    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000762578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2221  porin  35.77 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0634  porin  38.14 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0447  porin  32.77 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2645  porin  37.53 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0639  porin Omp2a  36.76 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.979561  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5842  porin  34.72 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2312  porin  33.94 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6754  porin  34.96 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0637  porin Omp2a  36.48 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2646  porin  36.13 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2075  porin  33.77 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0986  porin  34.2 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0668  porin  37.82 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1139  porin  34.83 
 
 		 335 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.509463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0670  porin  35.64 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3326  porin  32.9 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3597  porin  31.49 
 
 		 384 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1428  outer membrane protein  33.67 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0784054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1427  outer membrane protein  32.74 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.019713  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0447  porin family protein  27.57 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.720414  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0703  porin  40.1 
 
 		 522 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1479  porin  38.76 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1311  porin  37.85 
 
 		 553 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3510  porin  34.31 
 
 		 553 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.694103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3186  porin  34.31 
 
 		 553 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3381  porin  37.45 
 
 		 553 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0264  porin  32.62 
 
 		 559 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0925  porin  39.81 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.245538  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3909  porin  29.39 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0221  porin  32.23 
 
 		 533 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0131958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2915  hypothetical protein  26.48 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2266  putative porin  32.58 
 
 		 502 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5088  porin  35.19 
 
 		 550 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.0428662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3136  hypothetical protein  31.44 
 
 		 495 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0664  putative porin  36.93 
 
 		 512 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4328  porin  30.62 
 
 		 554 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4696  porin precursor domain-containing protein  28.32 
 
 		 521 aa  96.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4437  porin  33.04 
 
 		 560 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.380251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2957  putative porin  37.29 
 
 		 497 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3960  porin  30.62 
 
 		 554 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0553818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2143  hypothetical protein  42.74 
 
 		 495 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2414  putative Omp2b porin  32.73 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0118669  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4747  porin  34.26 
 
 		 551 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2891  putative Omp2b porin  31.34 
 
 		 506 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0130237  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3475  porin  35.78 
 
 		 546 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5089  porin  33.81 
 
 		 531 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4701  porin precursor domain-containing protein  29.41 
 
 		 521 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.200175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3036  putative Omp2b porin  31.82 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0539  porin  29.06 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2265  putative porin  37.5 
 
 		 506 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3823  porin  31.56 
 
 		 488 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366853  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3281  hypothetical protein  37.68 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.231223  hitchhiker  0.00622274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2696  porin  29.43 
 
 		 484 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4698  porin precursor domain-containing protein  27.62 
 
 		 519 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195117  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1873  porin  31 
 
 		 516 aa  90.5  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.239305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3824  porin  28.57 
 
 		 447 aa  89.7  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0323  putative Omp2b porin  27.82 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4954  porin  33.33 
 
 		 565 aa  87  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3063  porin precursor domain-containing protein  31.91 
 
 		 498 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.033522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1933  putative porin  32.14 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4187  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0628  porin  28.9 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3110  porin  36.23 
 
 		 547 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0734  porin  27.82 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0879191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3429  porin  35.51 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.418777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0502  putative Omp2b porin  27.31 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711534  normal  0.785623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2544  porin  27.62 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2286  porin  31.03 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4187  porin  40 
 
 		 107 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3226  hypothetical protein  32.5 
 
 		 119 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  22.84 
 
 		 360 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>