More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0883 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  60.23 
 
 
736 aa  847  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  60.46 
 
 
707 aa  861  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  53.07 
 
 
743 aa  677  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  51.84 
 
 
744 aa  708  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  53.52 
 
 
718 aa  727  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  65.8 
 
 
724 aa  941  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  52.3 
 
 
765 aa  679  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  51.99 
 
 
760 aa  691  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  64.05 
 
 
733 aa  884  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  51.18 
 
 
758 aa  707  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  60.4 
 
 
728 aa  845  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  53.03 
 
 
742 aa  710  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  65.86 
 
 
724 aa  951  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  50.93 
 
 
764 aa  685  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  54.02 
 
 
768 aa  725  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  52.3 
 
 
784 aa  680  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  52.09 
 
 
759 aa  732  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  54.49 
 
 
750 aa  694  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  49.58 
 
 
757 aa  693  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
714 aa  1462  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  52.74 
 
 
769 aa  705  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  65.8 
 
 
718 aa  941  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  54.29 
 
 
759 aa  709  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  54.14 
 
 
760 aa  706  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  45.62 
 
 
691 aa  507  1e-142  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  44.37 
 
 
732 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  47.37 
 
 
714 aa  482  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  45.05 
 
 
720 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  46.56 
 
 
714 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  45.09 
 
 
741 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  44.83 
 
 
734 aa  469  1e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  43.33 
 
 
735 aa  469  1e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  42.83 
 
 
727 aa  469  1e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  44.83 
 
 
728 aa  471  1e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  44.46 
 
 
727 aa  467  1e-130  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  44.65 
 
 
728 aa  468  1e-130  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  42.69 
 
 
734 aa  467  1e-130  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  43.67 
 
 
775 aa  465  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  42.01 
 
 
779 aa  461  1e-128  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  42.65 
 
 
739 aa  462  1e-128  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  41.63 
 
 
720 aa  461  1e-128  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  41.85 
 
 
776 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  44.28 
 
 
712 aa  452  1e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  42.74 
 
 
757 aa  453  1e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  41.63 
 
 
770 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  44.19 
 
 
651 aa  442  1e-122  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  39.75 
 
 
833 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  41.69 
 
 
763 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  41.69 
 
 
730 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  41.91 
 
 
750 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  42.16 
 
 
669 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  40.26 
 
 
723 aa  422  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  43.46 
 
 
656 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  41.13 
 
 
654 aa  417  1e-115  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  41.31 
 
 
712 aa  400  1e-110  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  41.87 
 
 
796 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  36.83 
 
 
788 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  38.23 
 
 
712 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  36.86 
 
 
788 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  37.15 
 
 
831 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  41.34 
 
 
810 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  37.66 
 
 
729 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  39.45 
 
 
776 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  41.37 
 
 
658 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  41.25 
 
 
727 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  41.76 
 
 
626 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  41.57 
 
 
763 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  37.23 
 
 
735 aa  363  5e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  38.02 
 
 
709 aa  360  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  36.72 
 
 
712 aa  360  5e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  37.15 
 
 
732 aa  357  4e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  39.12 
 
 
814 aa  354  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  38.13 
 
 
658 aa  351  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 
654 aa  351  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  38.7 
 
 
626 aa  350  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.89 
 
 
648 aa  350  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  34.14 
 
 
824 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 
824 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.98 
 
 
626 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  37.68 
 
 
755 aa  347  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  39.57 
 
 
750 aa  346  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.92 
 
 
751 aa  346  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  36.62 
 
 
680 aa  345  1e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  39.08 
 
 
830 aa  344  3e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  38.02 
 
 
776 aa  343  6e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  38.9 
 
 
830 aa  343  6e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 
744 aa  343  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  37.44 
 
 
815 aa  335  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.53 
 
 
648 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  38.67 
 
 
661 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  39.67 
 
 
699 aa  330  8e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.15 
 
 
761 aa  329  1e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  37.99 
 
 
692 aa  327  5e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.8 
 
 
618 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.87 
 
 
811 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  36.64 
 
 
693 aa  323  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.43648e-11  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  34.53 
 
 
727 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  36.43 
 
 
676 aa  317  5e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  35.44 
 
 
704 aa  315  2e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  35.42 
 
 
744 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>