More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0815 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  100 
 
 
326 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.9 
 
 
342 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.15 
 
 
347 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  27.62 
 
 
364 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.46 
 
 
348 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  30.42 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  26.05 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  26.37 
 
 
349 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  28.03 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.09 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  26.84 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.26 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.58 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.77 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.59 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  28.79 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.61 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.19 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.52 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  25.25 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.85 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0183  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.88 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25.54 
 
 
593 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.94 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0256  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  30.14 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.77 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  25.4 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  27.4 
 
 
346 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5319  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  30.28 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.78 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  22.38 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  28.64 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.94 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.3 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3124  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.21 
 
 
362 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.45434  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  29.44 
 
 
317 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.94 
 
 
362 aa  62.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  28.16 
 
 
328 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  28.64 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2537  putative taurine ABC transporter, substrate binding protein  30.99 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237782  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  25.52 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  24.4 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
915 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  28.81 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  28.16 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1383  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  31.76 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0150888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  26.21 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0777  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.59 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.06 
 
 
351 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3417  NMT1/THI5 like domain protein  32.67 
 
 
332 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0233  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  30.62 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.786536  decreased coverage  0.000160369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  28.27 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  27.67 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  32.04 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0248  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  30.62 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698542  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0257  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  30.14 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.953427  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3439  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  34.23 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  26.43 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  25.83 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4979  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  30.62 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213313  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  28.69 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.52 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  29.55 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  24.62 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.44 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.83 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.18 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.62 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.62 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  22.36 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  27.68 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  27.18 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.72 
 
 
345 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  27.18 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3091  hypothetical protein  26.92 
 
 
362 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 
344 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.31 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  26.39 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  22.46 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.83 
 
 
438 aa  56.2  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  25.43 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1372  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.5 
 
 
351 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.86 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.67 
 
 
322 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7503  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, aliphatic sulphonates  27.02 
 
 
353 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4331  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.97 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  26.39 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  24.83 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.39 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.12 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.08 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  25.12 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3846  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  32.28 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.36 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0622  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  29.55 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0123615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.21 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5578  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.59 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>