125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0776 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  100 
 
 
200 aa  380  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  48.95 
 
 
199 aa  154  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  47.28 
 
 
199 aa  144  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  47.28 
 
 
199 aa  144  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  51.83 
 
 
195 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  45.5 
 
 
191 aa  131  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  41.24 
 
 
203 aa  121  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  43.43 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  43.43 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  48.45 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  40.51 
 
 
197 aa  118  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  44.67 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  36.56 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  41.85 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  43.2 
 
 
192 aa  109  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  46.04 
 
 
145 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  39.47 
 
 
197 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  44.74 
 
 
185 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  41.94 
 
 
206 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  37.97 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  42.76 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  35.03 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  39.47 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  36.09 
 
 
199 aa  94.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  40.54 
 
 
207 aa  92  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  38.31 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  43.05 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  36.55 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  38.46 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  38.31 
 
 
198 aa  84.7  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  40.61 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  37.43 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  34.62 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  34.73 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  38.29 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  37.18 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  36.73 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  36.42 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  39.33 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  32.35 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  41.67 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  37.84 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  38 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  35.06 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  34.91 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  40.16 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  36.62 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  38.94 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  31.18 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  38.97 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  34.64 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  35.91 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  34.71 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  34.12 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  30.91 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  31.13 
 
 
167 aa  61.6  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  38.27 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  32.86 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  34.81 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  34.81 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  36.36 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  30.11 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  35.88 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  36.84 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.33 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  35.1 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  31.36 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  46.58 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.34 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  43.59 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  35.62 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  35.11 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  30.2 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  33.69 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  29.19 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  35.14 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  35.96 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  32.41 
 
 
187 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  33.77 
 
 
195 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  29.08 
 
 
189 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  31.72 
 
 
187 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  44.78 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  31.39 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.21 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  31.58 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  28.86 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  33.11 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  29.33 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  29.33 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  29.87 
 
 
191 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.67 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  34.75 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  33.97 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  40.44 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  31.07 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  42.31 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  36.59 
 
 
201 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  35.09 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  31.43 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>