102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0754 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  248  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  60 
 
 
133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  53.85 
 
 
386 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  55.12 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  52.99 
 
 
142 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  59.18 
 
 
386 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  58.18 
 
 
114 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  60.71 
 
 
126 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  62.39 
 
 
126 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  50.81 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  58.88 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  54.24 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  53.66 
 
 
125 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  47.9 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  44.88 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  47.58 
 
 
124 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  51.52 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  49.57 
 
 
126 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  44.92 
 
 
118 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  44.63 
 
 
132 aa  100  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  48.42 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  44.79 
 
 
111 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  42.74 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  45.63 
 
 
127 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  40.68 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  56.3 
 
 
125 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  54.55 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  56.3 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  58.82 
 
 
75 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  39.81 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  48.21 
 
 
133 aa  84  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  44.34 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  44.71 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  61.04 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  40.48 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  48.96 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  50 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  35.63 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  34.09 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  34.04 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  41.94 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  33.72 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  35.63 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  38.81 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  35.56 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  34.02 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  35 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  34.02 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  39.68 
 
 
87 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  47.73 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  35.8 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  32.65 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  43.14 
 
 
323 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  37.7 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  31.4 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  41.18 
 
 
323 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  31.4 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  34.62 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  31.4 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  32.89 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  38.46 
 
 
117 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  31.63 
 
 
124 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  35.06 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  39.06 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  36.92 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  36.92 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  36.92 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  36.14 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  32.97 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  32.94 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  37.29 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  38.46 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  43.1 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  30.14 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  32.93 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  31.65 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  31.82 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  28.26 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  30.14 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  33.85 
 
 
115 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  31.94 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  43.4 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  45.83 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  45.65 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  41.67 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  34.48 
 
 
249 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  28.95 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  36.92 
 
 
124 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  27.78 
 
 
146 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  39.13 
 
 
153 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  35.38 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  27.5 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  29.17 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  34.38 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  51.35 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  30.61 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  55.56 
 
 
100 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>