43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0645 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  100 
 
 
155 aa  309  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  69.08 
 
 
155 aa  217  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  60.54 
 
 
155 aa  185  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  60.4 
 
 
155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  60.14 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  54.97 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  64.67 
 
 
156 aa  167  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 
152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  55.1 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  54.3 
 
 
154 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  56.46 
 
 
154 aa  158  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  61.9 
 
 
154 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 
160 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
163 aa  154  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  54.79 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  53.1 
 
 
157 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  53.1 
 
 
157 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 
154 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  53.1 
 
 
157 aa  151  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  52 
 
 
160 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  53.55 
 
 
174 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  55.71 
 
 
154 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  52.08 
 
 
166 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  55.03 
 
 
153 aa  147  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 
162 aa  147  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  51.66 
 
 
162 aa  144  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 
154 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  47.22 
 
 
172 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  53.79 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  53.08 
 
 
168 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
166 aa  121  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
324 aa  121  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
324 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  41.82 
 
 
524 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
149 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
201 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
333 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  29.66 
 
 
308 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>