84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0624 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 312 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  57.96 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  57.56 
 
 		 316 aa  364  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  56.73 
 
 		 328 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  56.59 
 
 		 328 aa  354  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  53.67 
 
 		 314 aa  340  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  55.77 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  53.97 
 
 		 315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  55.13 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  54.49 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  52.13 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  47.81 
 
 		 311 aa  285  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  48.16 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  45.79 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  38.78 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  36.65 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  36.52 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  35.26 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.17 
 
 		 617 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  27.51 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  24.64 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  23.95 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  26.7 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  24.41 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2124  methionine synthase I  25.64 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0799  methionine synthase I  25.64 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.33 
 
 		 609 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  22.97 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  27.12 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.53 
 
 		 605 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  25.42 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.94 
 
 		 839 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  26.89 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.36 
 
 		 807 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  26.56 
 
 		 791 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  23.42 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  26.05 
 
 		 801 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  26.42 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  25.32 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3952  methionine synthase I  27.84 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  25.28 
 
 		 819 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  26.36 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0709  methionine synthase I  24.68 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  26.04 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  25.68 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  27.98 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  22.92 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3426  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.61 
 
 		 617 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  23.19 
 
 		 841 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  23.01 
 
 		 774 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1074  methionine synthase I  25.87 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.24236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  24.34 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  25.11 
 
 		 800 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.24 
 
 		 804 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  26.69 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  22.16 
 
 		 793 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1771  methionine synthase I  25.23 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.0676063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  27.06 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  28.18 
 
 		 811 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  28.12 
 
 		 813 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1468  methionine synthase I  24.34 
 
 		 340 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.799153  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  23.81 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  30.86 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  26.18 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  27.15 
 
 		 1178 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  24.03 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  30.86 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.76 
 
 		 615 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  30.86 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  22.18 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  30.86 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  26.36 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  27.31 
 
 		 841 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  22.39 
 
 		 1191 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  21.76 
 
 		 804 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  25.74 
 
 		 802 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1861  homocysteine S-methyltransferase  22.96 
 
 		 434 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  22.22 
 
 		 781 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  26.5 
 
 		 1158 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1961  methionine synthase  26.73 
 
 		 1253 aa  43.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.23883  hitchhiker  0.00552664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  26.98 
 
 		 818 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.5 
 
 		 1226 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  24.53 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  22.77 
 
 		 1183 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>