More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0600 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
706 aa  1399    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  51.56 
 
 
707 aa  588  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
705 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
705 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
706 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
679 aa  324  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
777 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
784 aa  321  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
679 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
756 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  32.04 
 
 
764 aa  312  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
781 aa  310  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
740 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
686 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
760 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
801 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2297  CheA signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
799 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
762 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  31.51 
 
 
768 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
741 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.76 
 
 
764 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
777 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
772 aa  293  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
808 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
742 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
783 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.77 
 
 
763 aa  286  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  36.13 
 
 
878 aa  284  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
777 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  31.3 
 
 
764 aa  280  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.05 
 
 
734 aa  278  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  31.01 
 
 
752 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  27.99 
 
 
798 aa  273  9e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.92 
 
 
789 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  35.26 
 
 
793 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  33.56 
 
 
769 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  27.26 
 
 
769 aa  267  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  27.44 
 
 
769 aa  266  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  27.44 
 
 
769 aa  266  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
896 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
896 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
765 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
762 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
767 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.54 
 
 
764 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  29.74 
 
 
770 aa  260  5.0000000000000005e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.53 
 
 
839 aa  259  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
649 aa  259  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
766 aa  257  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
755 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
865 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
865 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  29.76 
 
 
785 aa  253  9.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  29.08 
 
 
783 aa  252  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  26.18 
 
 
770 aa  252  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
1012 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
750 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
2539 aa  248  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
695 aa  246  8e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
753 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
2212 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
1065 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
756 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  28.68 
 
 
2048 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
830 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  30.56 
 
 
748 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
769 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
1758 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
2137 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  26.57 
 
 
2301 aa  239  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
748 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
769 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
804 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  34.6 
 
 
769 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  34.6 
 
 
769 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
769 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
2026 aa  238  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  34.09 
 
 
769 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.22 
 
 
774 aa  238  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
974 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  28.34 
 
 
2026 aa  238  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
808 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
756 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27.19 
 
 
1866 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.46 
 
 
974 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  28.4 
 
 
1983 aa  235  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
1127 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
2164 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  26.97 
 
 
1989 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  34.53 
 
 
832 aa  234  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  33.89 
 
 
864 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  33.89 
 
 
864 aa  234  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  29.04 
 
 
2301 aa  234  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.89 
 
 
864 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.89 
 
 
864 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.89 
 
 
864 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
1078 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.89 
 
 
864 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  33.97 
 
 
1079 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  29.08 
 
 
1643 aa  233  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>