204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0586 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  51.06 
 
 
3420 aa  851    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  100 
 
 
2926 aa  5561    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  50 
 
 
1571 aa  884    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  50.92 
 
 
3415 aa  848    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  50.76 
 
 
1068 aa  568  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  38.03 
 
 
1593 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  45.18 
 
 
950 aa  481  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  49.59 
 
 
1012 aa  474  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  42.15 
 
 
1108 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  41.3 
 
 
1113 aa  420  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  41.63 
 
 
2906 aa  406  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  43.28 
 
 
2578 aa  403  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  43.46 
 
 
1861 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.4 
 
 
2711 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  35.86 
 
 
3506 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  41.61 
 
 
1268 aa  359  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  41.25 
 
 
1259 aa  355  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  41.08 
 
 
1259 aa  353  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  41.08 
 
 
1285 aa  353  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  41.25 
 
 
1269 aa  352  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  42.03 
 
 
1254 aa  351  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.88 
 
 
2363 aa  260  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  42.73 
 
 
861 aa  252  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  40.13 
 
 
1550 aa  246  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.51 
 
 
1227 aa  193  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  31.72 
 
 
4391 aa  185  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  31.31 
 
 
4312 aa  179  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  30.55 
 
 
1115 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  30.78 
 
 
1093 aa  177  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  30.78 
 
 
1093 aa  177  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30 
 
 
1023 aa  165  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  30.5 
 
 
1806 aa  164  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  29.1 
 
 
1099 aa  162  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  30.49 
 
 
1741 aa  156  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.48 
 
 
1881 aa  155  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.35 
 
 
3629 aa  150  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  39.1 
 
 
1530 aa  144  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  28.68 
 
 
2637 aa  144  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  38.18 
 
 
1119 aa  143  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  28.54 
 
 
1067 aa  137  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  29.95 
 
 
1753 aa  136  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.82 
 
 
1327 aa  135  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.1 
 
 
1357 aa  134  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  30.85 
 
 
989 aa  133  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  43.52 
 
 
1508 aa  132  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  29.71 
 
 
2057 aa  132  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  31.1 
 
 
1626 aa  131  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  28.99 
 
 
1594 aa  129  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  42.11 
 
 
994 aa  129  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  33.05 
 
 
1762 aa  128  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  33.05 
 
 
1762 aa  128  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  33.19 
 
 
1770 aa  127  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.67 
 
 
1081 aa  125  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  32.91 
 
 
1763 aa  125  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  33.49 
 
 
1748 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  33.05 
 
 
1770 aa  123  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.48 
 
 
3089 aa  123  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  41.09 
 
 
2642 aa  122  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  34.07 
 
 
1971 aa  122  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  27.98 
 
 
1070 aa  121  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  28.74 
 
 
1579 aa  121  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  27.98 
 
 
1070 aa  120  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  27.95 
 
 
1327 aa  119  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.09 
 
 
1532 aa  119  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  31.34 
 
 
466 aa  119  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  30.68 
 
 
1882 aa  119  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  27.95 
 
 
1349 aa  118  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  29.47 
 
 
1040 aa  117  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  27.8 
 
 
1327 aa  117  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  36.62 
 
 
2365 aa  116  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  29.66 
 
 
825 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  36.62 
 
 
2346 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  41.6 
 
 
2003 aa  114  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  46.07 
 
 
1519 aa  112  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  52.89 
 
 
1086 aa  112  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.04 
 
 
1165 aa  112  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.04 
 
 
1165 aa  112  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  28.68 
 
 
819 aa  111  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.48 
 
 
818 aa  110  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  26.68 
 
 
773 aa  108  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  31.33 
 
 
852 aa  107  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.53 
 
 
868 aa  107  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  43.97 
 
 
3322 aa  106  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  29.63 
 
 
947 aa  103  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  41.12 
 
 
2396 aa  103  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  24.14 
 
 
1102 aa  102  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 
909 aa  102  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  38.79 
 
 
1632 aa  101  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  38.14 
 
 
3391 aa  101  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  37.66 
 
 
2407 aa  100  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.11 
 
 
1806 aa  100  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  35.14 
 
 
1458 aa  98.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  26.7 
 
 
955 aa  98.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  26.88 
 
 
955 aa  97.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  29.32 
 
 
1234 aa  96.3  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  35.93 
 
 
1782 aa  95.9  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.54 
 
 
1029 aa  95.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  38.92 
 
 
995 aa  92.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  27.98 
 
 
1250 aa  92.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  43.5 
 
 
1459 aa  92.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>