More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0517 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 254 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  61.21 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  56.05 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  57.71 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  54.07 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  59.91 
 
 		 257 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  61.65 
 
 		 241 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  52.34 
 
 		 254 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  52.94 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  57.75 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  59.17 
 
 		 231 aa  214  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  52 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  65.32 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  50.64 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  50.78 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  52.65 
 
 		 301 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  51.65 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  52.89 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  52.5 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  51.78 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  51.78 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  57.35 
 
 		 336 aa  198  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  62.5 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  66.44 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  61.64 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  51.49 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  52.31 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  44.21 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  52.15 
 
 		 338 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  73.6 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  53.29 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  53.49 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  54.79 
 
 		 439 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  55.1 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 460 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  56.35 
 
 		 484 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  44.59 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  58.73 
 
 		 120 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  51.8 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  43.26 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  42.36 
 
 		 206 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  42.97 
 
 		 174 aa  86.3  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  42.77 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  47.86 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  47.12 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.67 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  42.15 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  45.24 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  46.61 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.61 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  42.57 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  40.8 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  39.17 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  42.99 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  42.97 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.86 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  40.77 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  38.93 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  42.4 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  46.53 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.37 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  43.56 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  41.86 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  39.26 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  38.73 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  44.96 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  43.8 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  43.31 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  41.6 
 
 		 318 aa  75.1  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  34.64 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  43.08 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  40.34 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  37.42 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  39.23 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.02 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  40.8 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  35.44 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  42.62 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  46.46 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  34.78 
 
 		 188 aa  72  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 202 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  41.13 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>