More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0483 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
227 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
231 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
227 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
242 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  30.52 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.19 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.19 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  29.69 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
317 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
295 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
290 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
354 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
335 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
227 aa  72  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  29.75 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
208 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
226 aa  62.4  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  30.57 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
98 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  25.46 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  30.57 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
183 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4037  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
219 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.766436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0039  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  23.92 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  35.71 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  31.68 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  40 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  27.4 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 
233 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  25.35 
 
 
208 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 
194 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
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NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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