More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0394 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  357  7e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  73.68 
 
 		 175 aa  272  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  72.19 
 
 		 187 aa  264  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  72.19 
 
 		 187 aa  264  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  72.19 
 
 		 171 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  72.19 
 
 		 171 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  71.68 
 
 		 174 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  66.04 
 
 		 176 aa  228  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  61.4 
 
 		 175 aa  216  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  61.08 
 
 		 171 aa  213  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  60.82 
 
 		 175 aa  213  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  60 
 
 		 182 aa  213  9e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  59.17 
 
 		 175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  59.65 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  59.88 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  57.4 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  57.4 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  59.17 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  57.99 
 
 		 175 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  59.28 
 
 		 171 aa  207  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  59.28 
 
 		 171 aa  207  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  57.39 
 
 		 193 aa  198  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  61.08 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  61.08 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  54.3 
 
 		 188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  56 
 
 		 180 aa  194  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  54.02 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  53.25 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  55.88 
 
 		 196 aa  187  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  57.42 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  53.25 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  53.61 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  53.61 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  51.46 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  51.81 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  53.01 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  50.89 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  51.19 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  49.72 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  50.9 
 
 		 167 aa  171  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  51.22 
 
 		 168 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  50.9 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  51.22 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  50.9 
 
 		 168 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4570  peptide deformylase  50 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  50.9 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  50.61 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  48.78 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  50.3 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  50 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  50 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  46.75 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  49.7 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  50 
 
 		 168 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  53.89 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  50.3 
 
 		 169 aa  164  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  50.6 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  49.39 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  45.2 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  53.05 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  49.39 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  47.34 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  49.4 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  49.69 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  49.1 
 
 		 167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  50 
 
 		 170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  52.23 
 
 		 170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  52.1 
 
 		 170 aa  161  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  44.63 
 
 		 184 aa  161  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  52.1 
 
 		 170 aa  160  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  47.88 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  50.87 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  50.87 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  45.3 
 
 		 185 aa  157  5e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  45.78 
 
 		 167 aa  158  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  49.68 
 
 		 172 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  50 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  47.9 
 
 		 167 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  46.55 
 
 		 173 aa  157  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  51.83 
 
 		 169 aa  157  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  47.9 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  47.9 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  47.9 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  49.1 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  49.1 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  49.11 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0521  peptide deformylase  43.79 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  48.78 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  51.23 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  44.2 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  46.71 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  45.14 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  48.52 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  48.24 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  46.71 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  46.99 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  48.17 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  47.9 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  48.17 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  47.9 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>