More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0355 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  71.43 
 
 		 463 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  78.57 
 
 		 463 aa  750    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  67.1 
 
 		 464 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  70.63 
 
 		 463 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  71.74 
 
 		 466 aa  678    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  71.96 
 
 		 462 aa  680    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  70.87 
 
 		 472 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  78.35 
 
 		 463 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  68.55 
 
 		 469 aa  654    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  71.68 
 
 		 475 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  67.1 
 
 		 464 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  78.35 
 
 		 478 aa  748    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  70.78 
 
 		 482 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  71.52 
 
 		 472 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  71.24 
 
 		 469 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  70.65 
 
 		 472 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  71.3 
 
 		 472 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  68.83 
 
 		 471 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  71.02 
 
 		 469 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  100 
 
 		 463 aa  944    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  71.21 
 
 		 463 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  70.72 
 
 		 469 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  68.91 
 
 		 474 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  68.18 
 
 		 462 aa  655    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  71.09 
 
 		 472 aa  661    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  68.47 
 
 		 465 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  69.7 
 
 		 463 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  66.02 
 
 		 462 aa  628  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  66.01 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  68.98 
 
 		 472 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  66.45 
 
 		 464 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  64.5 
 
 		 465 aa  620  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  65.43 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  64.27 
 
 		 464 aa  613  9.999999999999999e-175  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  68.61 
 
 		 464 aa  608  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  64.15 
 
 		 544 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  63.77 
 
 		 492 aa  602  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  63.7 
 
 		 465 aa  600  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  64.5 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  63.32 
 
 		 461 aa  598  1e-170  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  64.54 
 
 		 465 aa  601  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  63.54 
 
 		 461 aa  595  1e-169  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  61.47 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  61.71 
 
 		 465 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  58.21 
 
 		 459 aa  560  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  61.47 
 
 		 463 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  58.21 
 
 		 459 aa  558  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  59.3 
 
 		 464 aa  557  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  61.49 
 
 		 463 aa  554  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  61.49 
 
 		 461 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  60.99 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  63.46 
 
 		 458 aa  553  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  61.89 
 
 		 458 aa  549  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  59.57 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  60.04 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  59.83 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  58.61 
 
 		 471 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  60.18 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  60.22 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  60 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  60.83 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  60.96 
 
 		 631 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  59.48 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  60.39 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2715  fumarate hydratase  63.56 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  60.39 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 462 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  58.99 
 
 		 456 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  60.18 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  59.13 
 
 		 465 aa  542  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  62.07 
 
 		 471 aa  544  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  57.42 
 
 		 463 aa  541  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  58.91 
 
 		 467 aa  541  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  58.66 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  60.48 
 
 		 462 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  60.48 
 
 		 462 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  60.48 
 
 		 462 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0965  fumarate hydratase, class II  58.26 
 
 		 465 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  61.74 
 
 		 487 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 462 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 462 aa  537  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  58.3 
 
 		 464 aa  538  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>