More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0315 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  626  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  62.75 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  59.49 
 
 		 285 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.94 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.7 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  46.51 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  50 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  48.06 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.74 
 
 		 301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  45.52 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  38.98 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  31.71 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  33.55 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  33.68 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  32.75 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.54 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.68 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  33.45 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  33.22 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  34.89 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  32.51 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  32.51 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.3 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  34.64 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.24 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  33.8 
 
 		 316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  33.79 
 
 		 292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  32.16 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  35.69 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  32.53 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  34.26 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  34.26 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  33.91 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  34.95 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  33.21 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  31.33 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  35.99 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.35 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  33.45 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  33.22 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  33.09 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  35.9 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.51 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  31.23 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  28.84 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  32.78 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  32.65 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.61 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  31.85 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  29.45 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  32.65 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  30.27 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  32.75 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  32.17 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  32.19 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  30.46 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  35.46 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  32.37 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  29.23 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  31.05 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  28.4 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.78 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  29.35 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  30.39 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.72 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.63 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  27.14 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.1 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  29.62 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  28.85 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  32.59 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  29.59 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  31.62 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  28.62 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  31.67 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  30.45 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  31.25 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  30.94 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  31.27 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  27.92 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  32.89 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  27.36 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.07 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  32.99 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.62 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.43 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  27.97 
 
 		 338 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  28.79 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  31.86 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  31.37 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>