164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0257 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0974  SpoVR family protein  73.75 
 
 
512 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0535  SpoVR family protein  63.62 
 
 
505 aa  660    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.468104  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0257  SpoVR family protein  100 
 
 
516 aa  1076    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6312  SpoVR family protein  62.15 
 
 
512 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1029  SpoVR family protein  85.21 
 
 
513 aa  883    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1691  SpoVR family protein  59.3 
 
 
519 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2818  SpoVR family protein  61.01 
 
 
516 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0209056  normal  0.553922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2559  SpoVR family protein  60.85 
 
 
516 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0555763  normal  0.797029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1223  SpoVR family protein  61.05 
 
 
522 aa  620  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297925  normal  0.137117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2336  SpoVR family protein  58.98 
 
 
523 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.615666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2061  SpoVR family protein  58.98 
 
 
523 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0174  SpoVR family protein  60.68 
 
 
517 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00467153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2022  SpoVR family protein  58.4 
 
 
523 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7067  SpoVR family protein  59.44 
 
 
528 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6238  SpoVR family protein  58.45 
 
 
525 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3961  SpoVR family protein  58.24 
 
 
523 aa  596  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0276367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0034  SpoVR family protein  56.37 
 
 
522 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0748204  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  55.35 
 
 
510 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  55.35 
 
 
510 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  55.38 
 
 
519 aa  559  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  54.49 
 
 
510 aa  561  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  55.35 
 
 
510 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  55.15 
 
 
510 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  55.35 
 
 
510 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  56.02 
 
 
510 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  56.02 
 
 
510 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  54.95 
 
 
510 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  54.69 
 
 
515 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  56.02 
 
 
510 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  54.67 
 
 
519 aa  558  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  56.02 
 
 
510 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  56.02 
 
 
510 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  55.1 
 
 
511 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  56.02 
 
 
510 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  53.19 
 
 
515 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  54.11 
 
 
511 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  54.97 
 
 
532 aa  551  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  55.1 
 
 
519 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  54.75 
 
 
510 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  53.74 
 
 
519 aa  548  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  53.98 
 
 
509 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  54.75 
 
 
510 aa  551  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  53.33 
 
 
513 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  53.89 
 
 
511 aa  547  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  53.2 
 
 
511 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  53.61 
 
 
505 aa  541  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  52.24 
 
 
521 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  52.1 
 
 
507 aa  544  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  53.94 
 
 
521 aa  541  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  53.46 
 
 
520 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  53.99 
 
 
517 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  53.75 
 
 
538 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  52.92 
 
 
516 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  54.6 
 
 
517 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  52.55 
 
 
511 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2448  SpoVR family protein  53.07 
 
 
506 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0619548  normal  0.114389 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  52.34 
 
 
511 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  52.55 
 
 
511 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02753  SpoVR family protein  50.1 
 
 
515 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  51.98 
 
 
508 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  53.25 
 
 
520 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  53.61 
 
 
520 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  54.27 
 
 
516 aa  537  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  51.58 
 
 
508 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  53.03 
 
 
578 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  53.33 
 
 
507 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  53.33 
 
 
507 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  52.35 
 
 
520 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  52.07 
 
 
517 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  51.38 
 
 
508 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  51.19 
 
 
508 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  54.29 
 
 
522 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  52.7 
 
 
508 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  51.81 
 
 
505 aa  531  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  52.7 
 
 
508 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  52.7 
 
 
508 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  52.13 
 
 
508 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  52.88 
 
 
559 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  52.64 
 
 
560 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  53.06 
 
 
523 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  53.63 
 
 
559 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  53.19 
 
 
559 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2007  SpoVR family protein  53.43 
 
 
552 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  53.44 
 
 
507 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  53.19 
 
 
559 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  52.88 
 
 
559 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  52.64 
 
 
560 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  52.64 
 
 
560 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  52.49 
 
 
508 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  52.64 
 
 
560 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  52.64 
 
 
560 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  52.64 
 
 
560 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  55.1 
 
 
522 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  53.53 
 
 
557 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  55.1 
 
 
522 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  54.9 
 
 
522 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  53.43 
 
 
560 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  52.28 
 
 
507 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  51.65 
 
 
504 aa  528  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  51.16 
 
 
542 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>