More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0171 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  54.78 
 
 		 1035 aa  656    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  42.64 
 
 		 1410 aa  684    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1192 aa  2390    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  58.62 
 
 		 1035 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.67 
 
 		 1055 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.43 
 
 		 1138 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.37 
 
 		 1296 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 		 836 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 969 aa  416  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.09 
 
 		 728 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 1031 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 1191 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 1188 aa  393  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 1149 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 1000 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  43.33 
 
 		 1201 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 981 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 1005 aa  369  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  36.78 
 
 		 846 aa  257  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 841 aa  257  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 853 aa  239  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 		 717 aa  232  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 798 aa  225  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 523 aa  223  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 389 aa  216  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 778 aa  215  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 773 aa  210  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  40 
 
 		 773 aa  207  6e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 844 aa  206  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 377 aa  205  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 911 aa  204  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  43.39 
 
 		 511 aa  202  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 		 511 aa  202  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  40.94 
 
 		 503 aa  201  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 511 aa  200  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 513 aa  199  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 468 aa  197  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 704 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  40.91 
 
 		 511 aa  195  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  39.84 
 
 		 470 aa  194  6e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 846 aa  194  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0595123  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 784 aa  193  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 456 aa  193  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 582 aa  192  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  37.45 
 
 		 470 aa  191  5.999999999999999e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 518 aa  191  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 600 aa  191  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  39.2 
 
 		 513 aa  190  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 769 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 512 aa  190  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 505 aa  190  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 1046 aa  190  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  37.84 
 
 		 288 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 617 aa  190  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 1255 aa  189  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 513 aa  189  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  40.5 
 
 		 774 aa  189  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 511 aa  189  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 533 aa  188  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  40.32 
 
 		 513 aa  187  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 607 aa  187  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  40.32 
 
 		 513 aa  187  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  39.92 
 
 		 532 aa  187  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 620 aa  187  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 627 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  28.86 
 
 		 823 aa  187  9e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 587 aa  187  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 774 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 531 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 882 aa  187  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 697 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  39.5 
 
 		 771 aa  186  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 1015 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 530 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 530 aa  185  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 775 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 784 aa  184  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 763 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 770 aa  183  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 484 aa  184  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  39.15 
 
 		 783 aa  183  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  40.33 
 
 		 790 aa  183  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 536 aa  183  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 775 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  39.15 
 
 		 783 aa  183  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  40 
 
 		 771 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 1068 aa  182  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 502 aa  181  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1352 aa  181  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 594 aa  181  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  39.85 
 
 		 648 aa  181  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 605 aa  180  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 646 aa  181  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 772 aa  180  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 769 aa  180  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 631 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1548 aa  181  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 614 aa  180  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>