More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0133 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  100 
 
 
306 aa  622  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  59.49 
 
 
324 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  54.76 
 
 
298 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  59.49 
 
 
324 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.25239e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  53.59 
 
 
322 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7046e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  53.27 
 
 
322 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  57.45 
 
 
322 aa  339  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  57.45 
 
 
321 aa  338  7e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  57.09 
 
 
321 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  57.09 
 
 
321 aa  338  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.33829e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  57.09 
 
 
321 aa  338  8e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.68482e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  53.29 
 
 
321 aa  337  1e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.82355e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  53.29 
 
 
321 aa  337  1e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  6.73134e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  57.09 
 
 
321 aa  337  2e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.97265e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  51.57 
 
 
320 aa  312  5e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  51.57 
 
 
320 aa  312  5e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.70129e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  51.57 
 
 
320 aa  312  5e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17371e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  51.57 
 
 
320 aa  312  6e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.24878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  51.22 
 
 
320 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  52.65 
 
 
321 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  51.22 
 
 
320 aa  308  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.0516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  50.33 
 
 
316 aa  308  6e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  50.7 
 
 
320 aa  307  2e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  50.7 
 
 
305 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  50.17 
 
 
320 aa  302  5e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  43.91 
 
 
662 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  42.41 
 
 
300 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  41.48 
 
 
319 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  41.54 
 
 
346 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  39.29 
 
 
310 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  39.19 
 
 
309 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  36.59 
 
 
308 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  35.96 
 
 
330 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.4163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  35.96 
 
 
330 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.00605e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  38.85 
 
 
329 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  33.87 
 
 
340 aa  165  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  32.21 
 
 
313 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  33.1 
 
 
316 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  32.18 
 
 
329 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  32.97 
 
 
331 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  31.58 
 
 
336 aa  140  2e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.03 
 
 
331 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  32.88 
 
 
348 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2115e-07 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  29.08 
 
 
317 aa  129  4e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  28.25 
 
 
272 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  27.8 
 
 
314 aa  115  8e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  29.09 
 
 
314 aa  115  9e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  29.45 
 
 
305 aa  115  9e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  28.25 
 
 
313 aa  115  1e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  29.05 
 
 
319 aa  114  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.53945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  29.05 
 
 
319 aa  114  1e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  5.65066e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  30 
 
 
358 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  28.2 
 
 
301 aa  112  7e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  29.71 
 
 
314 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.17 
 
 
312 aa  110  2e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.17 
 
 
312 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.72 
 
 
314 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  27.64 
 
 
315 aa  109  7e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.55327e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  28.99 
 
 
314 aa  108  8e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  28.99 
 
 
314 aa  108  8e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  28.99 
 
 
314 aa  108  8e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.12566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.99 
 
 
314 aa  108  8e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.45758e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.86 
 
 
326 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.99 
 
 
314 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.76883e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.45 
 
 
311 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
313 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.68 
 
 
314 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.68 
 
 
314 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.68 
 
 
314 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.68 
 
 
314 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  27.55 
 
 
333 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  26.41 
 
 
312 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
327 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.34 
 
 
314 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  30.34 
 
 
311 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
327 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  26.71 
 
 
337 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  27.08 
 
 
306 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  28.07 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  26.44 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
380 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  26.99 
 
 
359 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  25.95 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  25.95 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.95 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.95 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  25.95 
 
 
300 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  26.97 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  28.91 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  26.77 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
353 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
353 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  27.46 
 
 
353 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.41 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  26.67 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  26.28 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  26.25 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  26.55 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  25.89 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>