47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0099 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1046    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.96 
 
 		 500 aa  346  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  41.1 
 
 		 502 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.04 
 
 		 512 aa  301  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4699  hypothetical protein  35.49 
 
 		 472 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0214281  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  29.29 
 
 		 505 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4180  parallel beta-helix repeat protein protein  30.06 
 
 		 513 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.0401044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  33.82 
 
 		 547 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  26.25 
 
 		 665 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  28.4 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  36.81 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3575  pectate lyase L precursor  32.34 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1929  hypothetical protein  26.45 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  35.24 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0468  protein of unknown function DUF1565  45.57 
 
 		 653 aa  60.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.672167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0371  hypothetical protein  46.03 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.34 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0361  hypothetical protein  44.83 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  31.03 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  29.73 
 
 		 759 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26480  hypothetical protein  30.04 
 
 		 907 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178741  normal  0.268207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1549  putative outer membrane protein  37.5 
 
 		 644 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0233  putative outer membrane protein  38.96 
 
 		 638 aa  53.5  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0292  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.17 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.81 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.640976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  30.3 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05700  hypothetical protein  26.1 
 
 		 514 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0732468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1743  Cna B domain-containing protein  28.57 
 
 		 1384 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  34.31 
 
 		 468 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2305  pectate lyase  27.27 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.708632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2354  hypothetical protein  27.31 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  31.3 
 
 		 768 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3115  hypothetical protein  46.43 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2045  pectate lyase  26.29 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1773  pectate lyase  28.57 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1024 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3869  fibronectin type III domain-containing protein  40.3 
 
 		 1431 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.849627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  31.43 
 
 		 297 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.81 
 
 		 1412 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  34.88 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1515  hypothetical protein  39.78 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000161589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3111  hypothetical protein  42.86 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1934  hypothetical protein  30.33 
 
 		 360 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  31.71 
 
 		 965 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  31.48 
 
 		 415 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2044  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.64 
 
 		 367 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.039257  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  34.74 
 
 		 453 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>