26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0095 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0095  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0401  hypothetical protein  56.98 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0308  hypothetical protein  55.81 
 
 
88 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0322  hypothetical protein  55.81 
 
 
88 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.835097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0196  hypothetical protein  55.81 
 
 
88 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0225  hypothetical protein  56.1 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0589  hypothetical protein  52.33 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0158  hypothetical protein  55.81 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0554  hypothetical protein  41.86 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1035  hypothetical protein  44.71 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0463  hypothetical protein  39.53 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3808  hypothetical protein  45.35 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0320919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0792  hypothetical protein  39.53 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0752  hypothetical protein  38.37 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0869  hypothetical protein  39.29 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0737512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4618  hypothetical protein  39.53 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.549833  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1070  hypothetical protein  46.51 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0541  hypothetical protein  43.02 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.752321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1466  hypothetical protein  37.65 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64047  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0797  hypothetical protein  39.51 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  hitchhiker  0.00476248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3152  hypothetical protein  43.02 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412403  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3476  hypothetical protein  43.02 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.404419  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0451  hypothetical protein  42.5 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00606209  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3348  hypothetical protein  40.7 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.682693  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4533  hypothetical protein  43.68 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3260  hypothetical protein  38.37 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>