More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0094 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 363 aa  729    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.29 
 
 		 364 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.64 
 
 		 364 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.64 
 
 		 364 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.36 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.79 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.95 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.43 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.21 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  56.07 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.54 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.12 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.69 
 
 		 354 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.19 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.69 
 
 		 354 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.99 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.57 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.85 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.29 
 
 		 349 aa  327  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.27 
 
 		 364 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.35 
 
 		 359 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.48 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  49 
 
 		 364 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  52.42 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.27 
 
 		 367 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.19 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.57 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 354 aa  312  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  53.52 
 
 		 361 aa  312  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  49 
 
 		 358 aa  311  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.72 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.05 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.31 
 
 		 352 aa  309  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.15 
 
 		 358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.67 
 
 		 344 aa  288  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  48 
 
 		 343 aa  288  9e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 		 348 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.48 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  45.75 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  48.96 
 
 		 377 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  47.62 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.2 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  45.2 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.2 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.33 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.84 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.73 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.73 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.69 
 
 		 349 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.04 
 
 		 351 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.48 
 
 		 365 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 		 339 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  46.81 
 
 		 340 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.73 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.06 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.41 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.75 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.35 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 		 340 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.43 
 
 		 339 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  44.97 
 
 		 346 aa  272  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 		 347 aa  272  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.08 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2155  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.35 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  44.63 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.72 
 
 		 357 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 		 339 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2138  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.73 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.25 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.21 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  43.94 
 
 		 367 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 		 350 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  44.48 
 
 		 348 aa  266  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.03 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  45.48 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.32 
 
 		 335 aa  266  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 341 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  43.59 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 		 336 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.79 
 
 		 344 aa  263  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  47.11 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>