13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0092 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0092  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  293  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0313  hypothetical protein  49.62 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0329  hypothetical protein  49.62 
 
 
151 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.447796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0406  hypothetical protein  45.58 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0163  putative signal peptide protein  42.2 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.873664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0220  hypothetical protein  32.26 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.924448  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0191  hypothetical protein  33.94 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0240  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4819  hypothetical protein  31.11 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195522  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4568  hypothetical protein  23.26 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0849  hypothetical protein  23.24 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0641204  normal  0.700231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0833  hypothetical protein  22.29 
 
 
217 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0582083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0917  hypothetical protein  32.81 
 
 
194 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>