More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0088 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  81.41 
 
 		 425 aa  696    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  81.65 
 
 		 425 aa  698    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 425 aa  867    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  80.47 
 
 		 425 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  69.75 
 
 		 410 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  68.41 
 
 		 409 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  68.16 
 
 		 409 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  67.25 
 
 		 409 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  66.83 
 
 		 409 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  65.59 
 
 		 409 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  66.58 
 
 		 409 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  66.58 
 
 		 409 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  73.8 
 
 		 433 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  73.43 
 
 		 414 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  70.93 
 
 		 462 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  71.81 
 
 		 431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  71.43 
 
 		 414 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  68.06 
 
 		 439 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  70.68 
 
 		 462 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  71.43 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  70.68 
 
 		 462 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  69.15 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  62.56 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  60.99 
 
 		 406 aa  527  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  64.34 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  65.5 
 
 		 405 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  65 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  62.5 
 
 		 403 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  60.49 
 
 		 406 aa  519  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  62 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  61.75 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  64.25 
 
 		 405 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  63.09 
 
 		 403 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  61 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.75 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  60.15 
 
 		 408 aa  507  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  63.2 
 
 		 407 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  62.03 
 
 		 408 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  64 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  63.16 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  60.15 
 
 		 409 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  61.62 
 
 		 407 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  60.76 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  57.32 
 
 		 407 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  56.82 
 
 		 407 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  62.09 
 
 		 404 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  61.25 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  59.4 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  61.75 
 
 		 406 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  58.42 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  58.17 
 
 		 407 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  58.17 
 
 		 407 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  57.92 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  59.45 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  54.5 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  57.54 
 
 		 406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  57.22 
 
 		 421 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  56.93 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  55.24 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  53.58 
 
 		 401 aa  464  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  55.19 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  58 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  51.8 
 
 		 648 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  57.25 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  48.56 
 
 		 608 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  49.04 
 
 		 573 aa  405  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  53.26 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  51.12 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  47.47 
 
 		 403 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  48.99 
 
 		 400 aa  337  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.5 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.85 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.82 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.15 
 
 		 397 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.37 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.34 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  37.75 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.77 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.43 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.27 
 
 		 395 aa  235  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.91 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  34.43 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.28 
 
 		 398 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.16 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.09 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.8 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.72 
 
 		 396 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.39 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.1 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.15 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.49 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.32 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.96 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.32 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.6 
 
 		 395 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.32 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.95 
 
 		 399 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.7 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.32 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.46 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>