147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0085 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  280  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.85 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 266 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  46.97 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  50.82 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  52.54 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.62 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 319 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.62 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.46 
 
 		 280 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.39 
 
 		 200 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 1089 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.56 
 
 		 323 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  42.17 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.77 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.38 
 
 		 372 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  45.9 
 
 		 462 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3969  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54 
 
 		 232 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.61 
 
 		 182 aa  52.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  48.44 
 
 		 246 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 285 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.83 
 
 		 322 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 		 433 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.03 
 
 		 260 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.23 
 
 		 201 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.33 
 
 		 288 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.07 
 
 		 233 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.39 
 
 		 306 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.77 
 
 		 232 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.07 
 
 		 233 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 422 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.79 
 
 		 317 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 310 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  46.77 
 
 		 276 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 554 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.32 
 
 		 629 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.7 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.68 
 
 		 274 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.07 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  35.23 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000277513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  46.67 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.94 
 
 		 864 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 306 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  43.55 
 
 		 239 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 974 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  46.48 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.18 
 
 		 242 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.94 
 
 		 379 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.59 
 
 		 332 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2131  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.19 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 256 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3894  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.1 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  39.06 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  44 
 
 		 270 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  52.78 
 
 		 406 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 294 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  35.94 
 
 		 324 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  48.33 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 321 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3696  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  48.21 
 
 		 383 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  40.62 
 
 		 762 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 487 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  41.94 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.43 
 
 		 382 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 273 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  45.61 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 508 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 239 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  39.34 
 
 		 379 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  49.06 
 
 		 335 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  42.86 
 
 		 242 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  34.02 
 
 		 247 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.6 
 
 		 225 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  43.14 
 
 		 2277 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  43.33 
 
 		 438 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  44.44 
 
 		 297 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  41.94 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  42.11 
 
 		 387 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.25 
 
 		 268 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  38.57 
 
 		 204 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2410  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.03 
 
 		 247 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  48.39 
 
 		 268 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4180  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  48.33 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4246  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537178  normal  0.324419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4402  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  46.27 
 
 		 352 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0048  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlA  37.68 
 
 		 364 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0248425 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>