More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0051 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  100 
 
 		 272 aa  553  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  45.91 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  47.6 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  46.85 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  46.9 
 
 		 296 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  47.24 
 
 		 273 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  46.59 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  44.53 
 
 		 281 aa  208  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  44.53 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  44.53 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  43.53 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  44.14 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  44.14 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  44.14 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  44.14 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  44.14 
 
 		 315 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.68 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  31.44 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  33.08 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.35 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.84 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  30.4 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  26.56 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  30.33 
 
 		 299 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 304 aa  85.5  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  28.39 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  28.38 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  29.15 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  29.59 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  30.23 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  28.9 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  29.09 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  25.78 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  26.09 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  25.55 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  26.82 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1546  IclR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00070993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  28.21 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0349  IclR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000127041  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  26.15 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>