More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0044 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0044  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 445 aa  898    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.99 
 
 		 441 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.87 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0385  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.28 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1472  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2819  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 467 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0837  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.44 
 
 		 462 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1430  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.34 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0746057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24220  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.53 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1418  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  32.87 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  0.0862967 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0940  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.55 
 
 		 462 aa  156  9e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0465159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.44 
 
 		 428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2696  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2581  GntR-family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.9 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2672  GntR-family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2630  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 430 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2802  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00360  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  30.96 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4117  transcriptional regulator with aminotransferase and DNA binding domains (possibly involved in vitB6 biosynthesis)  27.04 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0018  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.22 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4162  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  28.33 
 
 		 493 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  29.45 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 473 aa  110  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  25.28 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 477 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.5 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 477 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  25.63 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 477 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2563  transcriptional regulator  27.29 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  25.06 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  26.45 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.61 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.12 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  28.22 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  28.22 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  23.89 
 
 		 480 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69750  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.477513  normal  0.557474 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 477 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 480 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 468 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.95 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  27.47 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  23.8 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  27.94 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.4 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.4 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  25.4 
 
 		 477 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  24.14 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.14 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 478 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  25.28 
 
 		 470 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  25.86 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1775  putative transcriptional regulator, GntR family  29.14 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000003497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  23.67 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 477 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  27.03 
 
 		 484 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  27.22 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  30.29 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.25 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  24.94 
 
 		 477 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  25.86 
 
 		 398 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6026  GntR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  26.71 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 397 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>