More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0038 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
533 aa  1102    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  55.32 
 
 
529 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  55.13 
 
 
529 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  53.89 
 
 
529 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  50.48 
 
 
525 aa  570  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  50.29 
 
 
525 aa  568  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  51.43 
 
 
525 aa  566  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  52.07 
 
 
525 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  51.59 
 
 
525 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  51.39 
 
 
525 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  51.32 
 
 
532 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  49.3 
 
 
535 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  47.78 
 
 
526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  47.23 
 
 
532 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  48.13 
 
 
528 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  47.91 
 
 
532 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  47.16 
 
 
552 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  47.6 
 
 
532 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  47.31 
 
 
532 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  47.54 
 
 
528 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  45.21 
 
 
528 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  45.64 
 
 
526 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  45.97 
 
 
545 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  44.89 
 
 
526 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  44.33 
 
 
549 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  40.04 
 
 
544 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  39.89 
 
 
544 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  38.74 
 
 
556 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  39.08 
 
 
545 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  39.08 
 
 
545 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  39.08 
 
 
525 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 
561 aa  364  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.55 
 
 
558 aa  362  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  37.55 
 
 
543 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  37.55 
 
 
558 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.55 
 
 
543 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
558 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.55 
 
 
558 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.55 
 
 
543 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  37.55 
 
 
543 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  38.49 
 
 
547 aa  361  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  39.76 
 
 
556 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  38.49 
 
 
547 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.36 
 
 
543 aa  360  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.02 
 
 
543 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.82 
 
 
543 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.82 
 
 
543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.82 
 
 
543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  40.12 
 
 
558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.82 
 
 
543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  38.72 
 
 
558 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.16 
 
 
543 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  37.92 
 
 
545 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 
533 aa  351  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  38.37 
 
 
555 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  38.48 
 
 
545 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  38.81 
 
 
539 aa  343  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 
536 aa  342  9e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  37 
 
 
545 aa  340  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  38.27 
 
 
554 aa  334  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  37.55 
 
 
538 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 
538 aa  333  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  36.76 
 
 
541 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  38.4 
 
 
560 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  37.01 
 
 
545 aa  329  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  36.73 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  36.73 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  36.73 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  37.45 
 
 
536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  36.73 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  36.73 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  36.73 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  36.96 
 
 
537 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  36.96 
 
 
537 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  36.73 
 
 
537 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  37.17 
 
 
537 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  37.17 
 
 
537 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  37.17 
 
 
537 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  36.73 
 
 
537 aa  326  7e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  37.35 
 
 
538 aa  326  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 
544 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  37.29 
 
 
534 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  37.08 
 
 
534 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  37.99 
 
 
538 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  34.98 
 
 
535 aa  319  7e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  35.62 
 
 
559 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  32.87 
 
 
543 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 
542 aa  309  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  34.91 
 
 
538 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  36.33 
 
 
545 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 
538 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  34.91 
 
 
538 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 
549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  36.65 
 
 
544 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.14 
 
 
537 aa  303  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 
538 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  32.52 
 
 
537 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 
539 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  35.18 
 
 
541 aa  300  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>