19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0016 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0016  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  286  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0740  hypothetical protein  56.82 
 
 
136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0789  hypothetical protein  56.06 
 
 
136 aa  148  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3970  hypothetical protein  53.68 
 
 
140 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0429  hypothetical protein  51.94 
 
 
136 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0510307  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0137  hypothetical protein  48.15 
 
 
136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171445  normal  0.390949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0187  hypothetical protein  51.11 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444813  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0216  hypothetical protein  51.11 
 
 
137 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378879  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0579  hypothetical protein  48.15 
 
 
137 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2205  hypothetical protein  43.17 
 
 
140 aa  105  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3038  hypothetical protein  45.31 
 
 
132 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3618  hypothetical protein  41.91 
 
 
138 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.852641  normal  0.135457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2236  hypothetical protein  44.19 
 
 
140 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2260  hypothetical protein  42.64 
 
 
140 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0583  hypothetical protein  44.19 
 
 
140 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0486  hypothetical protein  42.64 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.609033  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1577  hypothetical protein  46.21 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401749  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1320  hypothetical protein  46.21 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0990906  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2638  hypothetical protein  28.24 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>