70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0038 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0038  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0017  tRNA-His  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000497759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0294  tRNA-His  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0021  tRNA-His  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.730448  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0027  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_831  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000011255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00107575  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0032  tRNA-His  86.11 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30442  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0045  tRNA-His  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0186  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0087  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0015  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000558308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0015  tRNA-His  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.956741  normal  0.235739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAMetVIMSS1309206  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.218177  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0016  tRNA-His  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  93.94 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  93.94 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  86.54 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0026  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000000595128  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0043  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1158 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna1  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13674  tRNA-His  89.74 
 
 		 70 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0026  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0073  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0083  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0002  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269854  normal  0.234293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0008  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000747513  normal  0.235119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0013  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.55572e-16  normal  0.0212264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0020  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889352  normal  0.733975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0047  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.627276  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0024  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0030  tRNA-His  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.142316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0071  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0038  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0746306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0047  tRNA-His  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna33  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0335757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0043  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0043  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00198134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000050813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>