299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0036 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  96 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000649019  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  93.51 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0028  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0056  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0046  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0761072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt11  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0014  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0012  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000114825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0048  tRNA-Gly  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000333522  normal  0.379894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0022  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.997438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0036  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000263314  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0049  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0053  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000638306  hitchhiker  0.00279768 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0061  tRNA-Gly  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0018  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.045305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0014  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0020  tRNA-Gly  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0669163 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t44  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0414415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0008  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0052  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0006  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0216519  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly02  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0042  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0015  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0040  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0053  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000611222  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0600  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 155 bp  63.9  0.000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0018  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00221415  normal  0.014977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>