60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3621 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  100 
 
 
386 aa  770    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  45.51 
 
 
322 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  45.51 
 
 
318 aa  266  5e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  37.19 
 
 
496 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  41.22 
 
 
515 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  39.13 
 
 
539 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.94 
 
 
551 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  36.71 
 
 
538 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  36.62 
 
 
509 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  36.31 
 
 
537 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  36.65 
 
 
515 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  36.42 
 
 
540 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  36.31 
 
 
509 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  38.34 
 
 
546 aa  193  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  37.04 
 
 
588 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.91 
 
 
602 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.91 
 
 
602 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  37.23 
 
 
538 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  35.29 
 
 
590 aa  189  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  35.01 
 
 
579 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.6 
 
 
605 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  37.46 
 
 
552 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  37.33 
 
 
545 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  37.62 
 
 
565 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  35.49 
 
 
335 aa  182  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  33.33 
 
 
579 aa  182  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  35.09 
 
 
445 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  38.53 
 
 
322 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  35.48 
 
 
584 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  32.3 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  28.88 
 
 
308 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  28.88 
 
 
308 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  28.88 
 
 
308 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  28.88 
 
 
308 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  28.88 
 
 
308 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  27.9 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  28.88 
 
 
308 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  27.17 
 
 
308 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  28.47 
 
 
308 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  28.88 
 
 
308 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  30.41 
 
 
350 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  30.18 
 
 
332 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  34.67 
 
 
322 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  27.17 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  34.52 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  26.95 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  26.6 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  34.36 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  30.1 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  28.14 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1686  stage III sporulation protein AA  31.94 
 
 
323 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  31.98 
 
 
306 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  28.44 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  28.21 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  24.55 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  27.13 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  26.86 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  31.28 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1793  stage III sporulation protein AA  27.61 
 
 
334 aa  63.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  28.04 
 
 
162 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>