16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3545 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  100 
 
 
170 aa  343  5e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000561994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  88.1 
 
 
169 aa  310  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  85.71 
 
 
170 aa  306  8e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  60 
 
 
179 aa  202  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  38.27 
 
 
167 aa  107  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  39.47 
 
 
170 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  39.17 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  40 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  40.74 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  40.74 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0612  gp49  38.46 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  34.25 
 
 
238 aa  64.7  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  32.69 
 
 
242 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  32.46 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000729431  normal  0.496656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  28.24 
 
 
151 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  29.84 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000168807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>