More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3445 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  100 
 
 
428 aa  869  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  100 
 
 
428 aa  869  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  71.6 
 
 
431 aa  629  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  53.07 
 
 
429 aa  399  1e-110  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  52.73 
 
 
414 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  47.46 
 
 
419 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  51.34 
 
 
409 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  48.02 
 
 
425 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.02 
 
 
425 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  50.42 
 
 
437 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  45.23 
 
 
414 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  45.13 
 
 
453 aa  358  1e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  48.77 
 
 
431 aa  354  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  44.29 
 
 
431 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  52.23 
 
 
406 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  52.23 
 
 
402 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  49.86 
 
 
430 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  44.47 
 
 
405 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.8 
 
 
414 aa  349  5e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  49.73 
 
 
424 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.55 
 
 
418 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.55 
 
 
418 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  47.09 
 
 
425 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.02 
 
 
415 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  48.79 
 
 
427 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  45.84 
 
 
425 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  44.32 
 
 
414 aa  343  3e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  46.32 
 
 
437 aa  343  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  45.15 
 
 
406 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  47.91 
 
 
440 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  48.79 
 
 
418 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  47.75 
 
 
419 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  43.93 
 
 
427 aa  338  2e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  48.39 
 
 
449 aa  337  3e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  48.12 
 
 
445 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  48.12 
 
 
451 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.9 
 
 
430 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  46.56 
 
 
423 aa  327  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.86 
 
 
451 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  45.89 
 
 
448 aa  321  2e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  47.55 
 
 
420 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3258  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  47.45 
 
 
449 aa  318  8e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0587  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.76 
 
 
456 aa  310  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.271361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2631  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  44.59 
 
 
443 aa  302  7e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492263  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3784  oxidoreductase molybdopterin binding  45.78 
 
 
457 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  45.43 
 
 
425 aa  299  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  39 
 
 
445 aa  296  5e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.89133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2438  putative sulfite oxidase molybdopterin subunit  43.16 
 
 
457 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  41.06 
 
 
376 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  39.52 
 
 
370 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  35.91 
 
 
372 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  35.61 
 
 
369 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  34.06 
 
 
451 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.65 
 
 
400 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  32.13 
 
 
420 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.76 
 
 
415 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  35.91 
 
 
414 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.46 
 
 
453 aa  154  3e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  32.83 
 
 
410 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  35.24 
 
 
361 aa  149  1e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  33.63 
 
 
407 aa  148  2e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  34.07 
 
 
369 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  33.65 
 
 
369 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  36.42 
 
 
359 aa  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  29.79 
 
 
409 aa  143  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  34.75 
 
 
338 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  33.25 
 
 
403 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  32.7 
 
 
369 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  33.33 
 
 
866 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.31 
 
 
401 aa  137  3e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  35.92 
 
 
402 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 
411 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  32.66 
 
 
461 aa  132  1e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.2 
 
 
465 aa  132  1e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  32.66 
 
 
461 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.88 
 
 
401 aa  129  8e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.88 
 
 
417 aa  129  1e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.7 
 
 
405 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.7 
 
 
405 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  30.03 
 
 
363 aa  127  4e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 
457 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  29.29 
 
 
402 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  34.08 
 
 
349 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.16 
 
 
415 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  32.05 
 
 
406 aa  121  2e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3554  predicted protein  31.49 
 
 
375 aa  122  2e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298587  normal  0.425378 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  29.15 
 
 
403 aa  121  2e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  28.96 
 
 
402 aa  120  4e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  31.4 
 
 
408 aa  120  4e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  30.06 
 
 
408 aa  120  5e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.24 
 
 
400 aa  120  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.29 
 
 
410 aa  119  1e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.46 
 
 
414 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.57 
 
 
417 aa  117  4e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  31.38 
 
 
873 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.26 
 
 
335 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  29 
 
 
408 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.31 
 
 
501 aa  116  8e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  30.75 
 
 
412 aa  115  1e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  30.41 
 
 
414 aa  115  2e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>