More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3417 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  246  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  100 
 
 
120 aa  246  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  80.17 
 
 
136 aa  198  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  55.65 
 
 
139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  55.65 
 
 
131 aa  130  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  55.65 
 
 
131 aa  130  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  48.7 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
136 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  50.43 
 
 
141 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  47.32 
 
 
129 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 
131 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  50.43 
 
 
141 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 
141 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
135 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  50.44 
 
 
135 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
135 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
135 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 
154 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 
154 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 
154 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 
154 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  47.46 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  50.89 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  46.49 
 
 
141 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 
142 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  46.61 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  51.28 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  49.12 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  46.49 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  47.32 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  50.43 
 
 
141 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  44.74 
 
 
142 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 
132 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 
131 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  47.32 
 
 
263 aa  105  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  47.32 
 
 
260 aa  104  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 
176 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.48 
 
 
176 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  42.34 
 
 
176 aa  94  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  42.34 
 
 
176 aa  94  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 
265 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  48.62 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 
178 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3269  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 
165 aa  87.8  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 
175 aa  87  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  42.61 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
172 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  41.12 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  34.21 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  38.68 
 
 
185 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  35.45 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  38.6 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
134 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  38.39 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.55 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  32.73 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.68 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  38.68 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  38.68 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.68 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.68 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.68 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  33.64 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  39.05 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.03 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  37.72 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>