More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3192 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  100 
 
 
682 aa  1326    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  56.98 
 
 
679 aa  560  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1579  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.18 
 
 
883 aa  277  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0482933  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.84 
 
 
757 aa  259  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.69 
 
 
780 aa  230  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.85 
 
 
794 aa  228  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.07 
 
 
773 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.01 
 
 
778 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.12 
 
 
773 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.91 
 
 
759 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.89 
 
 
773 aa  218  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  29.67 
 
 
773 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.75 
 
 
773 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.67 
 
 
654 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.51 
 
 
773 aa  213  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.62 
 
 
795 aa  213  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.41 
 
 
773 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.7 
 
 
761 aa  213  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  31.03 
 
 
795 aa  212  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.51 
 
 
786 aa  210  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.23 
 
 
772 aa  209  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.23 
 
 
772 aa  209  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.69 
 
 
818 aa  208  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.53 
 
 
749 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28 
 
 
752 aa  203  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.24 
 
 
796 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.93 
 
 
814 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.1 
 
 
750 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.9 
 
 
775 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.28 
 
 
791 aa  183  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.12 
 
 
737 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.94 
 
 
789 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.66 
 
 
808 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  30.6 
 
 
747 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
840 aa  170  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.81 
 
 
835 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.86 
 
 
722 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.38 
 
 
738 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.83 
 
 
738 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.67 
 
 
771 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.5 
 
 
737 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.22 
 
 
797 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.54 
 
 
781 aa  157  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.33 
 
 
766 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  26.51 
 
 
746 aa  154  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.5 
 
 
770 aa  153  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0140  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.87 
 
 
868 aa  153  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.68 
 
 
798 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.18 
 
 
809 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  43.29 
 
 
348 aa  151  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
283 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.36 
 
 
770 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 
451 aa  150  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.8 
 
 
745 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 
281 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 
295 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  31.38 
 
 
872 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.01 
 
 
840 aa  145  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.87 
 
 
822 aa  145  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  29.94 
 
 
825 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  33.46 
 
 
284 aa  145  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.93 
 
 
784 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  36.48 
 
 
461 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.49 
 
 
802 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  35.77 
 
 
461 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  37.23 
 
 
453 aa  139  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.01 
 
 
860 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 
294 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  35.77 
 
 
461 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  35.77 
 
 
461 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.08 
 
 
837 aa  138  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  35.37 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.33 
 
 
761 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  27.55 
 
 
808 aa  136  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 
320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.87 
 
 
839 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.99 
 
 
846 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
352 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.82 
 
 
841 aa  133  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.22 
 
 
772 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  35.54 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  34.89 
 
 
300 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 
300 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 
300 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 
709 aa  131  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000127283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  36.32 
 
 
502 aa  131  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  34.04 
 
 
300 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.35 
 
 
815 aa  130  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 
406 aa  130  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  34.04 
 
 
300 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1680  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.87 
 
 
726 aa  130  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00317004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1645  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.87 
 
 
726 aa  130  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.550311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  34.47 
 
 
300 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0547  ComEC/Rec2-related protein  30.84 
 
 
900 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  23.9 
 
 
738 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  34.47 
 
 
300 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  34.47 
 
 
300 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  34.47 
 
 
300 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  34.47 
 
 
300 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
300 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>