153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3180 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  72.4 
 
 
468 aa  688    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  72.67 
 
 
468 aa  688    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 
449 aa  927    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  72.2 
 
 
439 aa  665    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  63.95 
 
 
441 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  62.98 
 
 
437 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  59.87 
 
 
474 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  58.07 
 
 
457 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  57.21 
 
 
438 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  57.59 
 
 
456 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  56.35 
 
 
453 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  56.7 
 
 
456 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  57.21 
 
 
438 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  56.49 
 
 
432 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  53.72 
 
 
451 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  53.27 
 
 
451 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  53.72 
 
 
451 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  53.27 
 
 
451 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  53.5 
 
 
451 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  53.5 
 
 
451 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  53.27 
 
 
451 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  53.27 
 
 
451 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  53.02 
 
 
451 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  53.02 
 
 
451 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  53.02 
 
 
451 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  53.02 
 
 
451 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  53.02 
 
 
451 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  51.93 
 
 
435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  51.37 
 
 
446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  52.28 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  51.45 
 
 
440 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  52.98 
 
 
438 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  52.82 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  52.24 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  50.45 
 
 
430 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  51.81 
 
 
439 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  46.56 
 
 
441 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  45.23 
 
 
441 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  46.4 
 
 
435 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  46.97 
 
 
435 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  45.76 
 
 
439 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  46.68 
 
 
462 aa  358  9e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  45.72 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  37.14 
 
 
489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 
490 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  35.27 
 
 
488 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  35.04 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  34.59 
 
 
490 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  36.08 
 
 
447 aa  256  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  34.1 
 
 
426 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 
426 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  30.67 
 
 
463 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  28.1 
 
 
460 aa  179  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  30.39 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 
453 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
487 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  28.7 
 
 
452 aa  156  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  27.91 
 
 
452 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  28.38 
 
 
460 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  27.03 
 
 
476 aa  153  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  27.51 
 
 
474 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0157  glycoside hydrolase family 4  28.82 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1959  glycoside hydrolase family 4  26.62 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0241776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  27.59 
 
 
436 aa  147  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  27.21 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0970  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  26.45 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0988  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 
480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  26.21 
 
 
441 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 
441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0394  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 
480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0289899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 
435 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0830  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 
464 aa  124  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0505  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 
470 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2449  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 
453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0853  Alpha-glucosidase  24.95 
 
 
463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  25.78 
 
 
441 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  25.78 
 
 
441 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  25.56 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  25.56 
 
 
441 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1676  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 
466 aa  117  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  25.56 
 
 
441 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  25.56 
 
 
441 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  27.38 
 
 
424 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 
424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0127  glycoside hydrolase family protein  22.64 
 
 
484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.416914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  25.56 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  25.56 
 
 
441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  25.56 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  26.93 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  35.32 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  23.61 
 
 
440 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 
450 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  25.88 
 
 
450 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  26.62 
 
 
416 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  26.16 
 
 
437 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  26.81 
 
 
441 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>