More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3166 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  61.28 
 
 		 516 aa  655    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  100 
 
 		 521 aa  1077    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  58.75 
 
 		 514 aa  636    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  63.62 
 
 		 522 aa  677    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  88.07 
 
 		 513 aa  920    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  71.84 
 
 		 520 aa  781    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  59.77 
 
 		 518 aa  659    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  62.92 
 
 		 508 aa  654    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  58.59 
 
 		 516 aa  646    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  60.16 
 
 		 516 aa  656    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  63.23 
 
 		 516 aa  657    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  59.11 
 
 		 515 aa  634  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  59.73 
 
 		 512 aa  632  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  58.41 
 
 		 517 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  58.32 
 
 		 531 aa  628  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  58.33 
 
 		 515 aa  629  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  58.87 
 
 		 517 aa  628  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  57.78 
 
 		 514 aa  626  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  58.95 
 
 		 516 aa  625  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  58.8 
 
 		 512 aa  623  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  58.37 
 
 		 510 aa  617  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  58.17 
 
 		 528 aa  616  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  58.17 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  58.17 
 
 		 510 aa  617  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  57.98 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  57.59 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  56.73 
 
 		 516 aa  610  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  56.63 
 
 		 522 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  56.81 
 
 		 514 aa  609  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  57.92 
 
 		 514 aa  608  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  56.47 
 
 		 531 aa  607  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  58.75 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  58.17 
 
 		 510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  56.67 
 
 		 517 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  58.28 
 
 		 520 aa  600  1e-170  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  57.78 
 
 		 510 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  58.82 
 
 		 550 aa  599  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  57.28 
 
 		 513 aa  600  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  56.12 
 
 		 511 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  56.23 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  56.81 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  57.2 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  58.95 
 
 		 516 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  57 
 
 		 519 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  58.83 
 
 		 522 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  56.81 
 
 		 518 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  54.65 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  54.91 
 
 		 513 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  56.58 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  56.42 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  56.67 
 
 		 518 aa  589  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  58.06 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  58.4 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  55.64 
 
 		 510 aa  586  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  55.98 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  57.01 
 
 		 520 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  54.86 
 
 		 516 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  57.98 
 
 		 516 aa  585  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  53.79 
 
 		 524 aa  587  1e-166  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  55.06 
 
 		 516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  57.72 
 
 		 531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  54.86 
 
 		 516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  56.39 
 
 		 538 aa  581  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  54.93 
 
 		 513 aa  579  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  56.05 
 
 		 519 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  55.09 
 
 		 519 aa  578  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  56.3 
 
 		 512 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  54.56 
 
 		 523 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  53.71 
 
 		 508 aa  576  1.0000000000000001e-163  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  57.5 
 
 		 530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  56.67 
 
 		 537 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  55.25 
 
 		 510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  54.74 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  55.13 
 
 		 513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  56.31 
 
 		 508 aa  577  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  55.25 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  56.47 
 
 		 530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  54.86 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  55.66 
 
 		 519 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  54.99 
 
 		 514 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  55.85 
 
 		 519 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  55.86 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  54.56 
 
 		 510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  54.74 
 
 		 564 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  54.67 
 
 		 510 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  55.81 
 
 		 510 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  55.64 
 
 		 510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  54.63 
 
 		 522 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  54.34 
 
 		 532 aa  568  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  57.49 
 
 		 516 aa  571  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  54.16 
 
 		 513 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  54.28 
 
 		 510 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  55.34 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  52.15 
 
 		 515 aa  567  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  54.25 
 
 		 510 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  53.7 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  54.37 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  56.31 
 
 		 524 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  54.47 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  56.34 
 
 		 551 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>