More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3022 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  100 
 
 
112 aa  233  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  81.82 
 
 
110 aa  192  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  60 
 
 
110 aa  143  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  57.84 
 
 
104 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  56.86 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  56.86 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  53.21 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53.54 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  56.12 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  54.29 
 
 
109 aa  124  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  55.88 
 
 
141 aa  124  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  57.29 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  52.53 
 
 
107 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  54.9 
 
 
141 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  53.33 
 
 
109 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  51.46 
 
 
110 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  49.51 
 
 
108 aa  121  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  60.87 
 
 
109 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  60.87 
 
 
109 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  60.87 
 
 
109 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  51.82 
 
 
112 aa  120  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  52.48 
 
 
223 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  53.4 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  54.35 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  57.89 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  49.11 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  53.4 
 
 
107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  54.81 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  49.51 
 
 
108 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  50.48 
 
 
259 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  49.49 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  57.58 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  44.04 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  54.37 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  48.54 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  50.96 
 
 
107 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  52.04 
 
 
110 aa  117  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  49.51 
 
 
108 aa  116  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  49.04 
 
 
113 aa  116  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  52.48 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  51.43 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  115  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  45.19 
 
 
238 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  51.52 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  50.49 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  49.52 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  49.52 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  49.52 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  49.5 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  57.78 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  56.04 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  49.52 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  52 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  52.48 
 
 
106 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  53.4 
 
 
109 aa  114  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  51.02 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  49 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  48.57 
 
 
259 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  50.96 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  50.46 
 
 
109 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  45.79 
 
 
107 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  52.58 
 
 
109 aa  114  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  114  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  114  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  45.79 
 
 
107 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  44.86 
 
 
148 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  49.5 
 
 
125 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  54.17 
 
 
107 aa  114  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  45.79 
 
 
107 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  46.23 
 
 
109 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  50.52 
 
 
109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  57.78 
 
 
106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  48.08 
 
 
107 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  48.6 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  52.58 
 
 
108 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>