113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3002 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  100 
 
 
591 aa  1189    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  48.44 
 
 
579 aa  475  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  43.11 
 
 
565 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  34.26 
 
 
781 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  30.57 
 
 
633 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  29.56 
 
 
686 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  29.05 
 
 
670 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  50 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  46.07 
 
 
403 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  27.95 
 
 
675 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  29.34 
 
 
636 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  28.64 
 
 
636 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  30.1 
 
 
594 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  29.05 
 
 
677 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  44.74 
 
 
450 aa  197  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  40.17 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1425  VanW family protein  26 
 
 
617 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  28.74 
 
 
642 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  37.26 
 
 
510 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  28.88 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  35.22 
 
 
435 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0186  VanW family protein  28.34 
 
 
608 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.953695 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  28.8 
 
 
591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  35.07 
 
 
474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  38.97 
 
 
436 aa  130  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  26.62 
 
 
580 aa  127  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0204  VanW family protein  27.8 
 
 
604 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  32.4 
 
 
467 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  31.56 
 
 
503 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  42.86 
 
 
600 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  27.55 
 
 
690 aa  123  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  28.73 
 
 
481 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  26.33 
 
 
582 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  36.26 
 
 
520 aa  118  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  28.28 
 
 
569 aa  117  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  32.3 
 
 
491 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  29.59 
 
 
580 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  30.17 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  36.84 
 
 
569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  24.51 
 
 
576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  37.57 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  32.14 
 
 
303 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  32.14 
 
 
303 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  34.43 
 
 
303 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  34.43 
 
 
303 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  34.43 
 
 
303 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  34.43 
 
 
303 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  34.43 
 
 
303 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  34.43 
 
 
303 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  34.43 
 
 
303 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  34.43 
 
 
303 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  29.87 
 
 
420 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  27.79 
 
 
765 aa  107  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  33.88 
 
 
304 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  28.42 
 
 
748 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  29.39 
 
 
420 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  29.39 
 
 
420 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  29.39 
 
 
420 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0965  VanW family protein  25.73 
 
 
776 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.964336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  31.48 
 
 
456 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  29.39 
 
 
420 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  28.72 
 
 
420 aa  105  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  29.39 
 
 
420 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  34.22 
 
 
420 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  35.08 
 
 
420 aa  104  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  31.37 
 
 
738 aa  104  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  34.72 
 
 
420 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  31.49 
 
 
253 aa  103  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  30.7 
 
 
518 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  33.48 
 
 
305 aa  102  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  37.27 
 
 
489 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  28.88 
 
 
520 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4909  VanW family protein  24.91 
 
 
633 aa  100  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  32.85 
 
 
319 aa  100  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  27.08 
 
 
491 aa  99.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  24.67 
 
 
847 aa  100  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  32.74 
 
 
620 aa  99.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  31.22 
 
 
682 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  33.83 
 
 
219 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  35.22 
 
 
373 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  37.75 
 
 
366 aa  92.8  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  27.41 
 
 
559 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  24.24 
 
 
550 aa  92  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  25.39 
 
 
439 aa  92  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1397  vanW-related protein  26.74 
 
 
420 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000158977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  25.92 
 
 
567 aa  89.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  38.16 
 
 
248 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1209  vancomycin b-type resistance protein vanW, putative  26.01 
 
 
420 aa  88.2  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000880463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  34.92 
 
 
296 aa  84  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  29.36 
 
 
337 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  28.87 
 
 
279 aa  84  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  23.49 
 
 
892 aa  84  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  32.41 
 
 
276 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1773  VanW family protein  36.52 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2239  vancomycin B-type resistance protein VanW  32.39 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00319629  hitchhiker  0.00000191747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0991  VanW family protein  24.84 
 
 
1016 aa  80.5  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5507  VanW family protein  30.86 
 
 
277 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.170032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  40.35 
 
 
314 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  24.78 
 
 
772 aa  77.4  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2034  VanW  34.13 
 
 
290 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>