More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2989 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 356 aa  704    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  75.64 
 
 		 352 aa  537  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  47.89 
 
 		 340 aa  338  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  46.99 
 
 		 340 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  47.29 
 
 		 340 aa  335  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  46.22 
 
 		 339 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.07 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.78 
 
 		 339 aa  329  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  47.18 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  47.76 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 345 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  45.7 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  45.75 
 
 		 345 aa  295  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  46.76 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  47.35 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  45.53 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  46.53 
 
 		 353 aa  285  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  42.73 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  46.18 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 365 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  45.13 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  44.35 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  46.18 
 
 		 355 aa  278  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  45.88 
 
 		 355 aa  278  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0566  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 		 370 aa  278  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  46.36 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 		 401 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  45.35 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4469  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 		 379 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450699  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0727  uroporphyrinogen decarboxylase  43.21 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 355 aa  275  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.36 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  48.08 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  46.71 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  41.89 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  45.21 
 
 		 361 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 369 aa  271  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3861  uroporphyrinogen decarboxylase  41.64 
 
 		 370 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  43.07 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  40.76 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  40.76 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  42.18 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  42.18 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  44.84 
 
 		 351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  44.26 
 
 		 353 aa  269  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  44.12 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  45 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  41.42 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0010  uroporphyrinogen decarboxylase  42.66 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  43.66 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  43.7 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  42.48 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  42.48 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  43.24 
 
 		 355 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  40.56 
 
 		 380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  42.11 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  43.07 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  41.21 
 
 		 355 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  42.61 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  43.36 
 
 		 354 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  44.09 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  45.16 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  41.3 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  45.16 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0363  uroporphyrinogen decarboxylase  41.55 
 
 		 369 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178148  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  41.89 
 
 		 342 aa  265  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  44.09 
 
 		 361 aa  265  8.999999999999999e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3134  uroporphyrinogen decarboxylase  41.1 
 
 		 370 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>