More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2896 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  100 
 
 
113 aa  223  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  65.74 
 
 
109 aa  148  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 
106 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  54.72 
 
 
107 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  54.21 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 
106 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  53.21 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 
108 aa  110  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
105 aa  110  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  48.54 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  51.46 
 
 
107 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  48.15 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
115 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 
108 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  48.54 
 
 
103 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  47.57 
 
 
104 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 
108 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 
108 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 
104 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
116 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  46.6 
 
 
107 aa  101  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
105 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
109 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
105 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  50.51 
 
 
104 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
103 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
106 aa  99  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
112 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  48.45 
 
 
106 aa  97.8  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  52.81 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  43.56 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
103 aa  93.6  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  44.66 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  46.88 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
110 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  48.51 
 
 
112 aa  92.8  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  43.12 
 
 
107 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  53.7 
 
 
107 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  51.04 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  41.82 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  42.72 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  48.42 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  48.42 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
105 aa  91.3  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  41.82 
 
 
110 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4925  ribosomal protein L24  49.46 
 
 
93 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0021231  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  47.37 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  42.57 
 
 
107 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  51.02 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  44.09 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  43.43 
 
 
111 aa  84.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  47.37 
 
 
102 aa  84  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  48.98 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3994  ribosomal protein L24  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  41.58 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2285  50S ribosomal protein L24  54.05 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000123735  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  41.35 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  39.05 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  44.79 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  44.68 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  44.68 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0778  50S ribosomal protein L24  41.75 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177963  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  43.3 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  38.1 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  41.67 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  46.32 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  46.32 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1407  ribosomal protein L24  44.79 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0192  50S ribosomal protein L24  52.7 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0553712  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  43.33 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2218  50S ribosomal protein L24  54.05 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000567909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  42.86 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  44 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  45.16 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  43.01 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>