51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2838 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  100 
 
 		 126 aa  248  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  51.3 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  40 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  40.66 
 
 		 678 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 412 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  36.94 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  32.61 
 
 		 410 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 410 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  36.96 
 
 		 421 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  34.15 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 424 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  39.24 
 
 		 351 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 355 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  37.8 
 
 		 352 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 351 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  31.63 
 
 		 315 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  37.78 
 
 		 304 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  37.78 
 
 		 304 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  33.88 
 
 		 304 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  37.78 
 
 		 304 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  27.38 
 
 		 327 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 355 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 355 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  31.46 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  37.04 
 
 		 272 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  37.88 
 
 		 708 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  33.75 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  26.19 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  31.68 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  35.9 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  31.4 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  38 
 
 		 525 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  31.87 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 327 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  31.4 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  34.38 
 
 		 195 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 476 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  33.01 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  31.65 
 
 		 353 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 310 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  33.75 
 
 		 313 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  30.7 
 
 		 115 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>