More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2794 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 		 354 aa  696    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  75.63 
 
 		 358 aa  533  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.49 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.24 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.94 
 
 		 355 aa  332  8e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.82 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.32 
 
 		 376 aa  322  8e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.05 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.05 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.82 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.19 
 
 		 355 aa  309  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.13 
 
 		 359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.92 
 
 		 354 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.63 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.78 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.19 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.58 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.04 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.05 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.31 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.05 
 
 		 355 aa  295  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.01 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.5 
 
 		 358 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.76 
 
 		 355 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.98 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.7 
 
 		 357 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.78 
 
 		 357 aa  292  7e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.42 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  46.61 
 
 		 355 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  44.13 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.76 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  45.2 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.5 
 
 		 355 aa  285  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.07 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.3 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.53 
 
 		 355 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.9 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.54 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.83 
 
 		 351 aa  242  6e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  40.4 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.59 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.96 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  35.75 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  34.17 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  37.94 
 
 		 411 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  37.3 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  36.98 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  34.36 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  37.16 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.17 
 
 		 397 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.61 
 
 		 349 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  38.1 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.89 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  35.1 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  31.94 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  39.5 
 
 		 257 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  32.31 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  38.89 
 
 		 243 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.17 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.34 
 
 		 245 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.34 
 
 		 245 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  35.35 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.97 
 
 		 400 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.74 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.74 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  39.74 
 
 		 245 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.74 
 
 		 245 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.74 
 
 		 245 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.46 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 245 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  32.87 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.32 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  36.49 
 
 		 403 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  38.74 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  39.32 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  38.79 
 
 		 253 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0937  nucleotidyl transferase  38.03 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  37.46 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 		 240 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  35.37 
 
 		 393 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  34.13 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.99 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  35.76 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  37.89 
 
 		 247 aa  152  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.83 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.25 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 		 244 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.83 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  35.93 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.83 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.42 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.83 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4725  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.83 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  29.05 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  37.28 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  39.22 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  36.6 
 
 		 253 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>