More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2750 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  958    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  51.06 
 
 
464 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.28 
 
 
471 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  52.53 
 
 
449 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  52.53 
 
 
449 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  52.16 
 
 
457 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.34 
 
 
467 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  50.64 
 
 
462 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  50.32 
 
 
463 aa  475  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  51.32 
 
 
489 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.85 
 
 
404 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  46.14 
 
 
427 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.63 
 
 
459 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  46.7 
 
 
446 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.3 
 
 
443 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0973  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.13 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00533761  normal  0.376368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.98 
 
 
440 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.92 
 
 
436 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.03 
 
 
438 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.26 
 
 
438 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.92 
 
 
438 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.08 
 
 
460 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.48 
 
 
436 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  47.26 
 
 
439 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.47 
 
 
436 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.05 
 
 
439 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  44.88 
 
 
442 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  46.06 
 
 
453 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.39 
 
 
434 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  47.03 
 
 
436 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  47.03 
 
 
435 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  45.1 
 
 
441 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  48.81 
 
 
447 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  47.93 
 
 
434 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.09 
 
 
453 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  45.18 
 
 
453 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  42.89 
 
 
440 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.83 
 
 
438 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  45.95 
 
 
434 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  47.71 
 
 
434 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  46.51 
 
 
435 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  45.95 
 
 
434 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.8 
 
 
451 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  47.16 
 
 
438 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  48.03 
 
 
440 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  46.41 
 
 
433 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  47.28 
 
 
434 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.83 
 
 
436 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  47.16 
 
 
438 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  45.85 
 
 
448 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  46.61 
 
 
436 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  43.39 
 
 
459 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.83 
 
 
435 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  47.05 
 
 
456 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.17 
 
 
433 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.7 
 
 
457 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.38 
 
 
434 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  47.16 
 
 
438 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.3 
 
 
442 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.36 
 
 
457 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  44.64 
 
 
440 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.3 
 
 
433 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  42.95 
 
 
440 aa  371  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.51 
 
 
434 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.1 
 
 
437 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  47.82 
 
 
452 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.42 
 
 
447 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  44.98 
 
 
443 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  43.84 
 
 
443 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.51 
 
 
434 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.33 
 
 
445 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  43.91 
 
 
445 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.51 
 
 
439 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.98 
 
 
463 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  43.76 
 
 
440 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.76 
 
 
450 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.32 
 
 
434 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  46.51 
 
 
463 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.54 
 
 
440 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.54 
 
 
440 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.51 
 
 
436 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  41.23 
 
 
435 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.98 
 
 
448 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  44.23 
 
 
449 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  42.83 
 
 
445 aa  364  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.13 
 
 
444 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.24 
 
 
438 aa  363  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  43.86 
 
 
470 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.86 
 
 
470 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.86 
 
 
470 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.08 
 
 
442 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  44.26 
 
 
454 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  42.67 
 
 
438 aa  363  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  44.64 
 
 
440 aa  362  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.29 
 
 
437 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  44.26 
 
 
454 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  44.08 
 
 
442 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.22 
 
 
470 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  43.54 
 
 
438 aa  362  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.55 
 
 
450 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>